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laomian006木蟲 (小有名氣)
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[求助]
用NAMD模擬聚合物與微生物膜相互中用
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做聚合物（殼聚糖）與微生物生物膜（微生物膜主要由磷脂雙層膜和脂多糖構(gòu)成）相互作用動(dòng)力學(xué)。 我們知道蛋白質(zhì)分子和DNA分子的pdb文件都可以從數(shù)據(jù)庫(kù)下載。 在VMD插件中可以自動(dòng)生成磷脂雙層膜， 但是殼聚糖和脂多糖這兩種中等程度的大分子，沒法生成。我嘗試用VMD中的插件Molefacture來生成分子，發(fā)現(xiàn)實(shí)在不方便，請(qǐng)問您能夠有什么好的方法，可以生成非蛋白質(zhì)和非DNA的大分子。 |
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