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laomian006木蟲 (小有名氣)
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[求助]
用NAMD模擬聚合物與微生物膜相互中用
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做聚合物(殼聚糖)與微生物生物膜(微生物膜主要由磷脂雙層膜和脂多糖構成)相互作用動力學。 我們知道蛋白質(zhì)分子和DNA分子的pdb文件都可以從數(shù)據(jù)庫下載。 在VMD插件中可以自動生成磷脂雙層膜, 但是殼聚糖和脂多糖這兩種中等程度的大分子,沒法生成。我嘗試用VMD中的插件Molefacture來生成分子,發(fā)現(xiàn)實在不方便,請問您能夠有什么好的方法,可以生成非蛋白質(zhì)和非DNA的大分子。 |
新蟲 (初入文壇)
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