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shuizhao木蟲 (著名寫手)
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[求助]
請教一個代謝組學(xué)SCI修回的問題~高手請進(jìn)
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最近有一篇文章修回，但是有一個問題思考很久實在想不出來是什么意思，麻煩大家看下哈~ 問題是：Page 9, first paragraph and figures 3 and 4: The authors do not give clear information whether the groups SND（這個是治療組） vs. hypothyroid group（這個是模型組） or vs. control group are statistically different. 第9頁的第一段我寫的就是關(guān)于代謝組學(xué)中正常組和模型組建立PLS-DA模型得分圖，載荷圖和S-plot的過程，圖3和圖4分別為在正離子和負(fù)離子模式下，正常組和模型組之間的得分圖，載荷圖和S-plot。我就不明白這個reviewer說的“statistically different"是什么意思了？是指PLS-DA的得分圖還能算出是否有統(tǒng)計學(xué)差異嗎？才疏學(xué)淺望大家多多指教哈！ |
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fangang1111
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利用PCA或PLS-DA等多變量統(tǒng)計方法，能夠從大量多維數(shù)據(jù)中尋找出貢獻(xiàn)于分類的主要差異成分。然而，采用載荷圖發(fā)現(xiàn)組間差異代謝物是較宏觀的方法，并不能判斷觀察到的差異是否具有統(tǒng)計學(xué)意義（顯著性）。因此，有必要采用其他方法進(jìn)一步驗證化學(xué)計量學(xué)研究結(jié)果，并確證差異的顯著性。 我在前期投稿的過程中也遇到你類似的情況，審稿人給的是大修，也提出了相似的問題，最后我采用了兩種方法來驗證我的化學(xué)計量學(xué)結(jié)果： （1）對發(fā)現(xiàn)的marker進(jìn)行手動積分，然后做組間方差分析，觀察載荷圖上得出的marker在組間的差異是否有統(tǒng)計學(xué)意義。當(dāng)然，我用的是NMR，和你的不一樣，你用的是MS吧，那你可以直接用載荷圖發(fā)現(xiàn)的marker的峰面積為數(shù)據(jù)做組間方差分析。 （2）采用HPLC方法對發(fā)現(xiàn)的marker進(jìn)行含量測定，然后再做組間方差分析。 最終我大修后，直接接受。 |
9樓2012-10-06 21:21:04
獨(dú)步青云
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2樓2012-10-02 22:31:49
shuizhao
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4樓2012-10-03 07:22:53
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