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wanglang1987銅蟲 (小有名氣)
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[求助]
gromacs水中的溶菌酶案例,哪出錯了?
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gromacs水中的溶菌酶案例中,當(dāng)選擇力場后,出現(xiàn)Ｆile input/output error,這個(gè)是什么原因?在蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫下載file(text)格式還是file(gz)格式,下載完成后放在哪里?桌面還是gromacs文件夾?具體放在哪個(gè)文件夾呢? 溶菌酶.jpg |
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【答案】應(yīng)助回帖
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感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
zh1987hs: 金幣+3, 謝謝 2012-10-11 10:20:30
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你應(yīng)該仔細(xì)閱讀軟件給你提示的錯誤信息，還有就是要認(rèn)真讀讀手冊。 你的錯誤提醒里，很清楚的寫著“1AKI.pdb” 你再猜猜看，應(yīng)該是什么格式。 “下載完成后放在哪里?桌面還是gromacs文件夾?具體放在哪個(gè)文件夾呢?” 這個(gè)問題，打個(gè)比方，你想吃飯的時(shí)候，你是去餐廳還是去圖書館？ 要運(yùn)行的輸入文件肯定是要放在你的工作目錄里��？ 這種問題，你還可以試一試，放在桌面，或者是gromacs文件夾，運(yùn)行不了幾個(gè)問題，就會很混亂。 一個(gè)問題，一個(gè)工作目錄 |
2樓2012-10-10 21:12:56
wanglang1987
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3樓2012-10-11 08:48:42
wanglang1987
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4樓2012-10-11 10:21:41
【答案】應(yīng)助回帖
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感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
jiaoyixiong: 金幣+3, 贊 2012-10-11 10:50:25
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其實(shí)新手不是理由~呵呵~你需要知道的是你還沒有了解linux和win下操作的區(qū)別，如果你安好了gromacs,你可以自己在任何一個(gè)地方建個(gè)文件夾，比如/home/XXX/simulation.把你需要的文件全放進(jìn)這個(gè)文件夾，然后要調(diào)用gromacs進(jìn)行運(yùn)算時(shí)，直接輸入 cd /home/XXX/simulation,意思就是在這個(gè)文件夾下進(jìn)行操作，剩下的自己看看教程吧~ |
5樓2012-10-11 10:23:35
wanglang1987
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