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wanglang1987銅蟲 (小有名氣)
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[求助]
蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫(kù)沒(méi)有大豆蛋白PDB
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| 蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫(kù)沒(méi)有大豆蛋白PDB，要做大豆蛋白動(dòng)力學(xué)，求大豆蛋白PDB格式文件。沒(méi)有大豆蛋白就做不了嗎？ |
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koalabear8655
鐵蟲 (初入文壇)
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- 專業(yè): 生物大分子結(jié)構(gòu)與功能
【答案】應(yīng)助回帖
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感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
zh1987hs: 金幣+4, I-TASSER確實(shí)不錯(cuò)~哈哈 2012-10-19 18:38:52
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
zh1987hs: 金幣+4, I-TASSER確實(shí)不錯(cuò)~哈哈 2012-10-19 18:38:52
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是啊，你要做大豆蛋白的動(dòng)力學(xué)，總要知道你做的是哪一個(gè)蛋白吧（如果你自己都不知道，那就沒(méi)人知道了）～～知道了你要做的蛋白序列，就可以blast一下，找找看有沒(méi)有解出來(lái)晶體結(jié)構(gòu)啦，如果沒(méi)有完全一樣的，那就看看有沒(méi)有序列相似性比較高的蛋白解出來(lái)結(jié)構(gòu)了。如果有的話，就可以modeller或者其他建模軟件來(lái)構(gòu)建模型。 如果都找不到序列相似度大于30％的結(jié)構(gòu)的話就比較難辦了。。要從頭建模，這個(gè)難度就大了。 這里推薦一個(gè)做結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)很好的server，I－TASSER，只要把序列放進(jìn)去就好了。找模板啊，分析啊，都幫你做了。而且這個(gè)SERVER算是目前世界上準(zhǔn)確性最好的SERVER了。 http://zhanglab.ccmb.med.umich.edu/I-TASSER/ |
3樓2012-10-19 17:53:08
2樓2012-10-19 16:08:09
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