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wangjiaojiao新蟲 (初入文壇)
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[求助]
如何用MEGA軟件進(jìn)行MLVA分型的建樹呢？？
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本來聚類分析是用BioNumerics的，但是太貴了，買不起。要去別的實(shí)驗(yàn)室借用，很麻煩。 最近看文獻(xiàn)發(fā)現(xiàn)老外建樹很多用MEGA就可以了。 但是MEGA的主要功能是做序列比對和分子進(jìn)化分析的啊。 做MLVA分型，pcr之后跑毛細(xì)管電泳得到的結(jié)果整理出來是一堆重復(fù)序列的重復(fù)數(shù)， 比如一個(gè)菌株對應(yīng)的3個(gè)VNTR位點(diǎn)的重復(fù)數(shù)分別是12 13 17， 整理出來的結(jié)果就是類似這樣： 菌株1： 12 13 17 19 20 11 15 菌株2： 16 28 12 18 17 19 18 菌株3： 11 15 19 11 12 15 19 。。。 。。。 我想問的是，我怎么才能夠把這堆數(shù)字導(dǎo)入MEGA軟件中，構(gòu)建聚類樹呢？ 如果不能直接導(dǎo)入，我應(yīng)該做什么樣的處理呢？ 可能問題很簡單，但是我這個(gè)菜鳥看了半天說明書還是是一頭霧水啊~囧~~ 求有經(jīng)驗(yàn)的老師同學(xué)幫忙看看！謝謝！ |
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- 用MEGA建樹，怎樣才能轉(zhuǎn)化.txt到.meg
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2樓2017-11-15 09:33:57
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