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wangjiaojiao新蟲 (初入文壇)
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[求助]
如何用MEGA軟件進(jìn)行MLVA分型的建樹呢??
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本來聚類分析是用BioNumerics的,但是太貴了,買不起。要去別的實(shí)驗(yàn)室借用,很麻煩。 最近看文獻(xiàn)發(fā)現(xiàn)老外建樹很多用MEGA就可以了。 但是MEGA的主要功能是做序列比對和分子進(jìn)化分析的啊。 做MLVA分型,pcr之后跑毛細(xì)管電泳得到的結(jié)果整理出來是一堆重復(fù)序列的重復(fù)數(shù), 比如一個菌株對應(yīng)的3個VNTR位點(diǎn)的重復(fù)數(shù)分別是12 13 17, 整理出來的結(jié)果就是類似這樣: 菌株1: 12 13 17 19 20 11 15 菌株2: 16 28 12 18 17 19 18 菌株3: 11 15 19 11 12 15 19 。。。 。。。 我想問的是,我怎么才能夠把這堆數(shù)字導(dǎo)入MEGA軟件中,構(gòu)建聚類樹呢? 如果不能直接導(dǎo)入,我應(yīng)該做什么樣的處理呢? 可能問題很簡單,但是我這個菜鳥看了半天說明書還是是一頭霧水啊~囧~~ 求有經(jīng)驗(yàn)的老師同學(xué)幫忙看看!謝謝! |
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