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[求助]
怎么用DS尋找蛋白的結(jié)合位點或者是活性位點？
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| 如題，謝謝了。。 |
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2樓2012-10-30 14:41:54
wangyan10
鐵桿木蟲 (正式寫手)
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- 專業(yè): 理論和計算化學
【答案】應(yīng)助回帖
★ ★ ★ ★ ★
chaizhm: 金幣+5, 謝謝~ 2012-11-30 09:25:09
chaizhm: 金幣+5, 謝謝~ 2012-11-30 09:25:09
| 利用DS中的對接模塊進行對接研究時，活性位點的選擇，一般有這么幾種方法。首先就是完全靠DS軟件根據(jù)你要研究的化合物的性質(zhì)，有DS完成對活性位點的猜測，具體是怎么個過程，你可以好好看看DS尋找活性位點的說明書部分（find active site),這種操作之后，會得到很多組活性位點，然后結(jié)合你自己對這個化合物活性位點的理解（一般來源于對文獻的閱讀），選擇你想要的活性位點，進行對接。第二種方法，就是你對要進行對接的化合物有很深的了解，文獻中明確的指出，某個或者某幾個殘基，就是構(gòu)成活性位點的關(guān)鍵殘基。這樣，你就可以把這幾個氨基酸殘基選中，然后以它們?yōu)榛钚晕稽c，定義對接球，從而進行下一步的對接計算。 |
3樓2012-10-30 16:17:22
4樓2012-11-29 16:59:09
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