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beescity至尊木蟲(chóng) (著名寫(xiě)手)
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引物設(shè)計(jì)跨內(nèi)含子，操作中如何快速實(shí)現(xiàn)？
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經(jīng)常都在說(shuō)檢測(cè)mRNA，引物設(shè)計(jì)要跨內(nèi)含子，道理也知道。 大家平時(shí)在實(shí)際操作時(shí)候，是如何實(shí)現(xiàn)的��？ 難道設(shè)計(jì)出來(lái)了之后手動(dòng)去某段引物是不是在一個(gè)外顯子的邊緣，另一個(gè)又是在相鄰?fù)怙@子？這個(gè)方法是不是太慢了？ |
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2樓2012-10-29 15:18:34
3樓2012-10-29 22:43:32
beescity
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4樓2012-10-30 08:07:21
【答案】應(yīng)助回帖
★ ★
小丹木木: 金幣+2, 鼓勵(lì)應(yīng)助 2012-10-30 15:55:26
小丹木木: 金幣+2, 鼓勵(lì)應(yīng)助 2012-10-30 15:55:26
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一種是查找相似序列,以相似序列來(lái)預(yù)設(shè)計(jì),一種是用軟件設(shè)計(jì),比如primer5可以在某一區(qū)移動(dòng)找出相對(duì)得分高的作為引物.另外,有時(shí)候,只要一條引物是跨內(nèi)含子,就可以區(qū)分從基因組DNA擴(kuò)增和從mRNA擴(kuò)增.現(xiàn)在也有通過(guò)DNase降解處理來(lái)解決無(wú)法找到好的跨內(nèi)含子引物的問(wèn)題。 |
5樓2012-10-30 09:48:35
beescity
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6樓2012-10-30 10:41:01
mamadexiao
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7樓2012-10-30 21:54:30
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8樓2012-10-31 00:00:58
9樓2012-10-31 08:30:29
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10樓2012-11-02 09:12:20
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