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承諾的眷湖新蟲 (初入文壇)
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[求助]
CTAB法提取乳酸菌DNA后電泳圖有多條帶事怎么回事?
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本人用CTAB法提取乳酸菌DNA,marker右邊的5個泳道是加了溶菌酶處理的菌株,為何后面會有條帶?做16S是否有影響? 具體步驟如下: (1)每個離心管加1500ul培養(yǎng)物 (2)將上述裝有培養(yǎng)物的離心管放入離心機離心5分鐘(8000轉(zhuǎn)/s) (3)棄上清,再加1500ul培養(yǎng)物,混勻,放入離心機離心5分鐘(8000轉(zhuǎn)/s) (4)棄上清,加1mLTE緩沖液與沉淀物充分混勻,離心5分鐘(達到洗滌細菌沉淀物的目的) (5)棄上清,取567ulTE緩沖液置各有細菌沉淀物的小管,蓋上蓋子后放到震蕩機上進行震蕩或用移液槍吸推將其混勻 (6)加30ul10%SDS (7)加3ul20mol/L蛋白酶K,輕輕顛倒混勻 (8)放入37℃烘箱1h (9)加入100ul5mol/L的NaCL溶液,蓋上蓋子輕輕混勻 (10)加入80ulCTAB NaCL溶液,蓋上蓋子輕輕混勻 (11)65℃水浴10分鐘 (12)加入800ul酚/氯仿/異戊醇,輕輕混勻(去除蛋白質(zhì)和其他大分子物質(zhì)) (13)12000轉(zhuǎn)/s離心5分鐘 (14)取上清液(上層為蛋白質(zhì),下層為苯酚)放入對應(yīng)的新的離心管 (15)再次加入500ul/L酚/氯仿/異戊醇溶液 (16)再次離心5分鐘 注:若15步的離心界面層的蛋白質(zhì)很少且分層較明顯,可省略17、18兩步 (17)用移液槍取出500ul左右的上清液置對應(yīng)的新的離心管,加2倍體積的無水乙醇和1/10的3mol/L NaAC (18)離心,將DNA沉淀到小管底部 (19)倒去上清液,只留底部DNA沉淀,向各管加500ul70%乙醇(洗滌DNA) (20)12000轉(zhuǎn)/s離心5分鐘 (21)棄上清液,晾干,重溶于30ul的TE緩沖液 (22)加入1ulRNA酶,37℃消化1小時 (23)DNA樣品在-20℃保存?zhèn)溆?br /> marker(3000)右邊5個泳道在第6步前加入10微升10mg/mL的溶菌酶,希望各位大俠幫忙解釋下,或者提供該方法不足之處,謝謝! |
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