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smartcheng鐵蟲 (小有名氣)
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[求助]
castep中限制原子只沿某個(gè)方向運(yùn)動(dòng)
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我看前人的帖子說，只有修改.cell 文件，才能做到按方向性限制。如下所示，如果要限制第二個(gè)Al原子不能沿著X方向移動(dòng) 4 Al 2 1.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 5 Al 2 0.0000000000 0.0000000000 1.0000000000 這樣怎么會(huì)達(dá)到限制x方向的目的，這里面的1和0都代表什么啊。 原帖： Q3：如何在CASTEP計(jì)算中限制某個(gè)原子的移動(dòng)方向？ A3：CASTEP計(jì)算中只支持Fraction坐標(biāo)，不支持Coordinate坐標(biāo)。采用常規(guī)方式無法限制原子的移動(dòng)方向，需要手動(dòng)修改CASTEP的Cell文件，具體方式如下，在 %BLOCK POSITIONS_FRAC Al 0.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 Al 0.2270171283 0.2094837802 0.5009850469 Al 0.5000000000 0.0000000000 0.5000000000 Al 0.5000000000 0.5000000000 0.0000000000 %ENDBLOCK POSITIONS_FRAC 中包括每個(gè)原子的分?jǐn)?shù)坐標(biāo)，請(qǐng)留意每個(gè)原子的編號(hào)，在下面的計(jì)算中會(huì)有所幫助。 在Cell文件中，關(guān)于原子坐標(biāo)限制的部分如下： FIX_COM : false %BLOCK IONIC_CONSTRAINTS 1 Al 1 1.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 2 Al 1 0.0000000000 1.0000000000 0.0000000000 3 Al 1 0.0000000000 0.0000000000 1.0000000000 4 Al 3 1.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 5 Al 3 0.0000000000 1.0000000000 0.0000000000 6 Al 3 0.0000000000 0.0000000000 1.0000000000 7 Al 4 1.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 8 Al 4 0.0000000000 1.0000000000 0.0000000000 9 Al 4 0.0000000000 0.0000000000 1.0000000000 %ENDBLOCK IONIC_CONSTRAINTS 其中包括每行編號(hào)（紫色），原子類型（紅色），原子編號(hào)（綠色）和需要限制的分?jǐn)?shù)坐標(biāo)（黑色）。如果要限制第二個(gè)Al原子不能沿著X方向移動(dòng)，那么在該部分的設(shè)置如下： 1 Al 1 1.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 2 Al 1 0.0000000000 1.0000000000 0.0000000000 3 Al 1 0.0000000000 0.0000000000 1.0000000000 4 Al 2 1.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 5 Al 2 0.0000000000 0.0000000000 1.0000000000 6 Al 3 1.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 7 Al 3 0.0000000000 1.0000000000 0.0000000000 8 Al 3 0.0000000000 0.0000000000 1.0000000000 9 Al 4 1.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 10 Al 4 0.0000000000 1.0000000000 0.0000000000 11 Al 4 0.0000000000 0.0000000000 1.0000000000 注意，編號(hào)要順次后移，否則會(huì)出錯(cuò)，黑色部分分別對(duì)應(yīng)于x、y、z三個(gè)方向，完成后，使用Run Files方式即可進(jìn)行計(jì)算。 此外，在 %BLOCK CELL_CONSTRAINTS 1 2 3 4 5 6 %ENDBLOCK CELL_CONSTRAINTS 中可以限制晶胞向量的變化，第一行分別表示三個(gè)晶胞參數(shù)a、b、c， 第二行表示晶胞角度α、β、γ。上述結(jié)構(gòu)表明參數(shù)可以被優(yōu)化，如果需要加以限制，則需要改為0。 |
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