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蘋果落地金蟲 (正式寫手)
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[求助]
計(jì)算帶電氨基酸鏈的能量時(shí)，是不是需要把中和離子也要加上？
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| 請(qǐng)教各位蟲友，用gromacs計(jì)算幾條帶電氨基酸鏈的能量時(shí)，由于中和離子的存在，是不是需要把中和離子也要加上？但是這樣算出的結(jié)果有問題：相同的肽鏈，一種是呈現(xiàn)電中性，另外一種是帶有額外的靜電荷，在計(jì)算庫倫相互作用時(shí)，如果把中和離子也要考慮進(jìn)去發(fā)現(xiàn)，帶有額外靜電荷的肽鏈的靜電相互作用更強(qiáng)，而不是因?yàn)閹靷惻懦舛兊母酰? |
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