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代謝通量分析中的通量是指什么呀？
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看了好多文章關(guān)于代謝通量分析的 ，因為以前沒有接觸過所以不太明白，比如有個分別取發(fā)酵6、20、32h的數(shù)據(jù)(略)代入米根霉的通量模型進行計算,其通量分布結(jié)果如圖 我想知道這個通量到底是什么呀？是個物質(zhì)的濃度，反應(yīng)速率，還是其他的什么？另外，我是剛接觸這方面的實驗 以后課題就是這個了 ，哪位能推薦點代謝方面基礎(chǔ)的書或者文獻值了的，謝謝~ V[IZKV6~FU(V0}{_LYNK2ND.jpg |
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sophiejoy: 金幣+10 2012-11-12 09:36:31
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你是南林還是南工的： 通量是底物分配在各代謝途徑上的反應(yīng)的量，比如100mol的葡萄糖，用于幾丁質(zhì)的葡萄糖是3.67mol，向下進入F6P的是96.33mol 你給出的這種量是以葡萄糖的摩爾量為參考的（以100mol葡萄糖為設(shè)定用量），可以認為有多少葡萄糖這個6碳骨架用于該途徑上的反應(yīng)了，所以各個數(shù)值之和等于分支前流量，并且都不會大于最終的100mol。 有時還有一種不是以葡萄糖為基準的，而是以自身摩爾量為計算結(jié)果 如果一種物質(zhì)一分為二 這個通量就一下子增大了2倍 因此通量反映的是產(chǎn)物的得率 而非速率 |
2樓2012-11-10 17:47:14
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小木蟲: 金幣+0.5, 給個紅包，謝謝回帖
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舉個例子說明： 假設(shè)你在設(shè)定的取樣時間內(nèi)，比如1h，測得glucose消耗掉 5mol/L/h，而生成乳酸9mol/L/h，你用的這2個數(shù)據(jù)就是實際反應(yīng)速率。但是為了更直觀地反應(yīng)碳流向和產(chǎn)物得率，可以設(shè)定有100mol葡萄糖被消耗，那么乳酸就是180mol，顯然這個時候得率看起來更明顯，但是速率的特性已經(jīng)不存在了，有些文章里如果速率也是一個重要的數(shù)據(jù)，作者會把葡萄糖的反應(yīng)速率直接注釋在這個以葡萄糖為基準的通量圖上。 |
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sophiejoy10樓2012-12-17 16:40:09
wizardfan
至尊木蟲 (著名寫手)
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