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zq347597638新蟲 (小有名氣)
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[求助]
求幫忙,做過DGGE的請進(jìn)
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| 我做土壤DNA 后面要做DGGE 但是16s PCR結(jié)果一個(gè)在200bp,一個(gè)1000多bp,老師說200bp的太短了 做DGGE不能說明什么問題,1000多的太長了 DGGE跑不開,求做過的幫忙,DGGE能做多大的片段! |
木蟲 (小有名氣)

| 引物對DGGE的影響很明顯,建議結(jié)合最近Pyresequencing數(shù)據(jù),重新設(shè)計(jì)擴(kuò)增長度為200-500bp的引物,進(jìn)行試驗(yàn),不然所作結(jié)果沒有新意 |
新蟲 (小有名氣)
新蟲 (小有名氣)
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金蟲 (正式寫手)
| 我們做環(huán)境樣品的DGGE一般都是針對16S V3區(qū)片段,加上GC夾子在200bp左右。 |

木蟲 (正式寫手)
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之前做過,也是在200bp左右,我記得以前有篇文獻(xiàn)比較的幾種引物,發(fā)給樓主看看有沒有幫助啊 dgge重要.pdf(409.09KB) http://kuai.xunlei.com/d/GMKWDTQDZCOW?p=130497 |
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新蟲 (小有名氣)
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