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兩張DGGE圖如何做PCA分析
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| 兩張DGGE圖如何做PCA分析 |
生物表面活性劑 |
鐵桿木蟲 (正式寫手)
| 單憑DGGE條帶位置有無轉(zhuǎn)換呢成二進(jìn)制數(shù)據(jù)分析好像不科學(xué)吧。我覺得比較科學(xué)的方法是要把條帶亮度考慮進(jìn)去,理論上講,每個(gè)條帶可以代表一個(gè)物種或者OTU,那么條帶的亮度就代表這個(gè)物種在整個(gè)群落結(jié)構(gòu)中的相對(duì)豐度,所以條帶測(cè)序結(jié)果結(jié)合條帶亮度得到的物種數(shù)據(jù)就是比較合理的可以做PCA分析的數(shù)據(jù)。至于其他多樣性指數(shù)之類的,根據(jù)計(jì)算方法看,已經(jīng)把這些都考慮進(jìn)去了,所以可以直接用。 |
木蟲 (小有名氣)

銀蟲 (初入文壇)
鐵蟲 (初入文壇)
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