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seamas_gao2新蟲 (小有名氣)
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請問只有一個個體的某一個堿基發(fā)生變化，算SNP嗎？
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| 我做了幾十個個體的序列比對，發(fā)現(xiàn)某個堿基上只有一個個體發(fā)生了變化，請問這個 算SNP嗎，謝謝！ |
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從你自己的數(shù)據(jù)來看不能判斷是否是SNP SNP，single nucleotide polymorphism，單核苷酸多態(tài)性，是指基因組水平上由單個核苷酸的變異所引起的DNA 序列多態(tài)性,在群體中的發(fā)生頻率不小于1 %。SNP是對一個群體而言的概念 你現(xiàn)在做了幾十個個體的序列比對，發(fā)現(xiàn)某個堿基上只有一個個體發(fā)生了變化，這個堿基變化位點是否是SNP，你可以先查閱NCBI的SNP二級數(shù)據(jù)庫是否有記錄，如果有記錄那么這個位點可能是SNP位點，如果沒有記錄，那么你現(xiàn)有的樣本量還是不能得出這個位點是SNP位點的結(jié)論。 |
3樓2012-12-03 16:56:31
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