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seamas_gao2新蟲 (小有名氣)
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請(qǐng)問只有一個(gè)個(gè)體的某一個(gè)堿基發(fā)生變化，算SNP嗎？
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| 我做了幾十個(gè)個(gè)體的序列比對(duì)，發(fā)現(xiàn)某個(gè)堿基上只有一個(gè)個(gè)體發(fā)生了變化，請(qǐng)問這個(gè) 算SNP嗎，謝謝！ |
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【答案】應(yīng)助回帖
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感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
amisking: 回帖置頂 2012-12-03 21:07:54
amisking: 金幣+3, 鼓勵(lì)積極發(fā)帖幫助解答問題。 2012-12-03 21:08:04
小丹木木: 金幣+2, MolEPI+1, 鼓勵(lì)積極應(yīng)助 2012-12-04 21:09:03
seamas_gao2: 金幣+8, ★★★★★最佳答案, 十分感謝！ 2012-12-07 08:28:45
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seamas_gao2: 金幣+8, ★★★★★最佳答案, 十分感謝！ 2012-12-07 08:28:45
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從你自己的數(shù)據(jù)來看不能判斷是否是SNP SNP，single nucleotide polymorphism，單核苷酸多態(tài)性，是指基因組水平上由單個(gè)核苷酸的變異所引起的DNA 序列多態(tài)性,在群體中的發(fā)生頻率不小于1 %。SNP是對(duì)一個(gè)群體而言的概念 你現(xiàn)在做了幾十個(gè)個(gè)體的序列比對(duì)，發(fā)現(xiàn)某個(gè)堿基上只有一個(gè)個(gè)體發(fā)生了變化，這個(gè)堿基變化位點(diǎn)是否是SNP，你可以先查閱NCBI的SNP二級(jí)數(shù)據(jù)庫(kù)是否有記錄，如果有記錄那么這個(gè)位點(diǎn)可能是SNP位點(diǎn)，如果沒有記錄，那么你現(xiàn)有的樣本量還是不能得出這個(gè)位點(diǎn)是SNP位點(diǎn)的結(jié)論。 |
3樓2012-12-03 16:56:31
448935271
銀蟲 (小有名氣)
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2樓2012-12-03 15:06:30
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