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026li金蟲 (小有名氣)
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[交流]
擴散動力學(xué)模擬，total simulation time 等設(shè)置 已有3人參與
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在做多孔材料吸附小分子擴散時遇到設(shè)置問題： 1.total simulation time：一般設(shè)置多少？文獻里200ps，1ps time step；為什么在分析里MDS曲線只能畫出兩個點？比如設(shè)置200ps，文獻有說前100ps用來平衡的，后100ps不準(zhǔn)，那總的時間設(shè)置多少比較合適。 2.系綜選擇，文獻里有用NVE的，但是也有說先用NVT平衡，在用NVE計算的，這是為什么？ 3.文獻里有繪制出擴散路徑的，MS里有這個功能嗎？就是軌跡全部都記錄下來的，從一個孔擴散到另一個孔的過程。historyfile save every xxsteps這個選項在哪里設(shè)置的？ 吸附等溫線的問題： 1.在MS里adsorption isotherm 里沒有發(fā)現(xiàn)length simulation totally的設(shè)置，一般文獻里寫900萬步，configuration of system was record every xxstep。first300萬步用來平衡。這些都是如何找到的？MS里只有maximum loading steps；equilibration steps；production steps；return trajectory；return lowest energy frams選項。這些在模擬是代表什么？需要設(shè)置多少步合理？ 2.sample interval 設(shè)置25，就是描繪了25個吸附點嗎？ |
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