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Alex_ppz木蟲(chóng) (小有名氣)
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[求助]
求助關(guān)于轉(zhuǎn)錄組
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| 想問(wèn)下大家，目前做的低等動(dòng)物轉(zhuǎn)錄組測(cè)序，通過(guò)拼接得到了完整的轉(zhuǎn)錄組序列，但是這些序列有什么作用？想更深的研究應(yīng)該再做些什么工作？謝謝！ |
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anan_1223 
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【答案】應(yīng)助回帖
★ ★ ★
小丹木木: 金幣+3, 鼓勵(lì)應(yīng)助 2012-12-17 15:31:44
小丹木木: 金幣+3, 鼓勵(lì)應(yīng)助 2012-12-17 15:31:44
| 如果您的轉(zhuǎn)錄組信息是完整的，倒是可以利用它作為一個(gè)平臺(tái)，進(jìn)行一下的分析：1）樣本的差異分析，例如是不同處理、不同時(shí)間條件下的樣本差異信息、哪些途徑與這個(gè)處理相關(guān)、某些途徑的基因差異變化等等！2）還可以利用這個(gè)平臺(tái)進(jìn)行基因芯片定制，也可以分析以上的問(wèn)題！3）轉(zhuǎn)錄組層次預(yù)測(cè)得到的SNP分析，SSR分析等！4）不知道您這邊測(cè)序時(shí)，都進(jìn)行哪方面的分析了，其實(shí)還可以深入分析可變剪接、基因融合等信息，不過(guò)這個(gè)一般需要專(zhuān)業(yè)的技術(shù)服務(wù)公司來(lái)做！ |
10樓2012-12-17 10:31:16
gaoyang636
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【答案】應(yīng)助回帖
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
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轉(zhuǎn)錄組測(cè)序只是個(gè)手段，科學(xué)研究應(yīng)該先選定你感興趣的現(xiàn)象/機(jī)理，再去思考方法論的問(wèn)題；你這里貌似反過(guò)來(lái)了？ 另外，如果對(duì)目的還不清楚，那我冒昧揣測(cè) 你的轉(zhuǎn)錄組對(duì)照組啥的也沒(méi)有了？  另外問(wèn)個(gè)體外話：低等水產(chǎn)動(dòng)物的轉(zhuǎn)錄組，做了de novo拼接，怎么判斷得到“完整的轉(zhuǎn)錄組”了？  測(cè)序數(shù)據(jù)量有多大呢？ |
2樓2012-12-13 10:43:43
Alex_ppz
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3樓2012-12-13 16:42:46
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4樓2012-12-13 17:52:32
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8樓2012-12-17 08:46:27
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9樓2012-12-17 08:47:21
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