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cengjingmm新蟲 (初入文壇)
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[求助]
脂多糖和蛋白分子的對(duì)接用什么軟件好做？
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剛剛接觸分子對(duì)接的小白求教兩個(gè)問題： 1，在做蛋白+多糖的對(duì)接體系的時(shí)候，用的是autodock，運(yùn)行到autodock的時(shí)候出錯(cuò)，要修改MAX_RECORDS，應(yīng)該是可扭轉(zhuǎn)鍵太多了。因?yàn)檫@個(gè)脂多糖比較大，有五條相對(duì)自由度比較高的烴鏈。請(qǐng)問這種情況下，是不是不能用普通的小分子對(duì)接到蛋白上面的方法去做？什么軟件可以做呢？ 2，如果我有兩個(gè)蛋白A和B，分別都可以跟C（多糖）結(jié)合，有沒有辦法可以做這三個(gè)結(jié)合在一起的構(gòu)象？就是C+A+B的？ps:A。B可能共享C的結(jié)合位置，這點(diǎn)還不是很清楚。 非常感謝 |
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