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zhongshidaxt金蟲 (著名寫手)
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[求助]
polyrate2010 安裝求助
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各位蟲友們： 我做的是有關(guān)量子化學(xué)計(jì)算的課題，需要用到polyrate這個軟件。但是安裝之后測試不正確，各位大俠能不能幫我指出其中的問題，萬分感謝！ 基本信息： polyrate版本： 2010-A OS： linux 安裝過程中的相應(yīng)步驟： [lzzh@HeavyOil polyrate2010rp]$ ./configure Welcome to POLYRATE 2010-A! Do you want POLYRATE 2010-A to be your new default version of POLYRATE? [ yes ]: y Cleaning the src/ directory ... ... processor is x86_64 ... OS is Linux Is this running used to generate Makefile for RP-VTST or VRC-VTST? [ Choose 'RP' or 'VRC' ]: rp which: no ifort in (”/home/lzzh/amber10/bin:/home/lzzh/amber10/bin:/home/lzzh/gaussian/g09:”/bin:/home/lzzh/amber10/bin:/home/lzzh/gaussian/g09:/usr/lib64/qt-3.3/bin:/usr/local/bin:/usr/bin:/bin:/usr/local/sbin:/usr/sbin:/sbin:/home/lzzh/gaussian/g09/g09/bsd:/home/lzzh/gaussian/g09/g09/private:/home/lzzh/gaussian/g09/g09”:/home/lzzh/mpich2/bin:/home/lzzh/bin:/home/lzzh/gaussian/g09/g09/bsd:/home/lzzh/gaussian/g09/g09/private:/home/lzzh/gaussian/g09/g09”:/home/lzzh/mpich2/bin) ....did not find Intel Fortran compiler - ifort ....found GNU Fortran compiler - gfortran :/usr/bin/gfortran ....found MPI compiler :/usr/local/bin/mpif77 which: no icc in (”/home/lzzh/amber10/bin:/home/lzzh/amber10/bin:/home/lzzh/gaussian/g09:”/bin:/home/lzzh/amber10/bin:/home/lzzh/gaussian/g09:/usr/lib64/qt-3.3/bin:/usr/local/bin:/usr/bin:/bin:/usr/local/sbin:/usr/sbin:/sbin:/home/lzzh/gaussian/g09/g09/bsd:/home/lzzh/gaussian/g09/g09/private:/home/lzzh/gaussian/g09/g09”:/home/lzzh/mpich2/bin:/home/lzzh/bin:/home/lzzh/gaussian/g09/g09/bsd:/home/lzzh/gaussian/g09/g09/private:/home/lzzh/gaussian/g09/g09”:/home/lzzh/mpich2/bin) ....did not find Intel C compiler ....found GNU C compiler :/usr/bin/gcc ....found MPI C compiler :/usr/local/bin/mpicc Do the options chosen above look OK? [ yes ]: y ... installing .... creating Makefile ---- POLYRATE INSTALLATION COMPLETE ---- Have a nice day!  .... done with Makefile 顯示安裝完成，下面是測試過程： [lzzh@HeavyOil ch5]$ ./ch5j1tr1.jc gmake -s ../exe/polyrate2010-A.ch5.serial.exe ivtstm.F:5681.72: pause 'singular matrix in gaussj' 1 警告： 已刪除的特性：(1)處的 PAUSE 語句 ivtstm.F:5701.72: if (a(icol,icol).eq.0.) pause 'singular matrix in gaussj' 1 警告： 已刪除的特性：(1)處的 PAUSE 語句 main.F:22: Error: Can't open included file 'mpif.h' gmake[1]: *** [main.o] 錯誤 1 gmake: *** [CH5S] 錯誤 2 mv: 無法獲取"poly.fu1" 的文件狀態(tài)(stat): 沒有那個文件或目錄 mv: 無法獲取"poly.fu6" 的文件狀態(tài)(stat): 沒有那個文件或目錄 mv: 無法獲取"poly.fu14" 的文件狀態(tài)(stat): 沒有那個文件或目錄 mv: 無法獲取"poly.fu15" 的文件狀態(tài)(stat): 沒有那個文件或目錄 mv: 無法獲取"esp.fu61" 的文件狀態(tài)(stat): 沒有那個文件或目錄 結(jié)果就出現(xiàn)了上述過程中無法獲取相應(yīng)文件的問題。 RP-VTST or VRC-VTST分別安裝，都遇到的同樣的問題。自己整理了好久，也沒有解決。 各位大俠看是哪一步驟出了問題，期待回復(fù)，謝謝！ |
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flyingfish00
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【答案】應(yīng)助回帖
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zhongshidaxt: 金幣+10, ★有幫助, 我查出了是缺少intel編譯器的問題，但是在linux ubuntu 系統(tǒng)上安裝不上intel的編譯器，所以到現(xiàn)在還是沒能成功安裝polyrate 2013-01-08 15:03:52
gmy1990: 金幣+2 2013-01-08 16:49:11
zhongshidaxt: 金幣+10, ★有幫助, 我查出了是缺少intel編譯器的問題，但是在linux ubuntu 系統(tǒng)上安裝不上intel的編譯器，所以到現(xiàn)在還是沒能成功安裝polyrate 2013-01-08 15:03:52
gmy1990: 金幣+2 2013-01-08 16:49:11
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沒有 intel c 和 intel fortran compiler. 你去intel網(wǎng)站上下一個最新版的安裝一下。好像有2g大小。文件還是挺大的。 [ 發(fā)自手機(jī)版 http://www.gaoyang168.com/3g ] |
2樓2013-01-08 13:55:57
flyingfish00
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3樓2013-01-08 17:50:41
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5樓2013-09-05 12:29:55
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