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zhongshidaxt

金蟲(chóng) (著名寫(xiě)手)

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[求助] polyrate2010 安裝求助

各位蟲(chóng)友們：
我做的是有關(guān)量子化學(xué)計(jì)算的課題，需要用到polyrate這個(gè)軟件。但是安裝之后測(cè)試不正確，各位大俠能不能幫我指出其中的問(wèn)題，萬(wàn)分感謝！
基本信息：
polyrate版本： 2010-A
OS： linux
安裝過(guò)程中的相應(yīng)步驟：
[lzzh@HeavyOil polyrate2010rp]$ ./configure
Welcome to POLYRATE 2010-A!
Do you want POLYRATE 2010-A to be your
new default version of POLYRATE? [ yes ]: y
Cleaning the src/ directory ...

... processor is x86_64
... OS is Linux

Is this running used to generate Makefile for RP-VTST or VRC-VTST?
[ Choose 'RP' or 'VRC' ]: rp
which: no ifort in (”/home/lzzh/amber10/bin:/home/lzzh/amber10/bin:/home/lzzh/gaussian/g09:”/bin:/home/lzzh/amber10/bin:/home/lzzh/gaussian/g09:/usr/lib64/qt-3.3/bin:/usr/local/bin:/usr/bin:/bin:/usr/local/sbin:/usr/sbin:/sbin:/home/lzzh/gaussian/g09/g09/bsd:/home/lzzh/gaussian/g09/g09/private:/home/lzzh/gaussian/g09/g09”:/home/lzzh/mpich2/bin:/home/lzzh/bin:/home/lzzh/gaussian/g09/g09/bsd:/home/lzzh/gaussian/g09/g09/private:/home/lzzh/gaussian/g09/g09”:/home/lzzh/mpich2/bin)
....did not find Intel Fortran compiler - ifort
....found GNU Fortran compiler - gfortran :/usr/bin/gfortran
....found MPI compiler :/usr/local/bin/mpif77
which: no icc in (”/home/lzzh/amber10/bin:/home/lzzh/amber10/bin:/home/lzzh/gaussian/g09:”/bin:/home/lzzh/amber10/bin:/home/lzzh/gaussian/g09:/usr/lib64/qt-3.3/bin:/usr/local/bin:/usr/bin:/bin:/usr/local/sbin:/usr/sbin:/sbin:/home/lzzh/gaussian/g09/g09/bsd:/home/lzzh/gaussian/g09/g09/private:/home/lzzh/gaussian/g09/g09”:/home/lzzh/mpich2/bin:/home/lzzh/bin:/home/lzzh/gaussian/g09/g09/bsd:/home/lzzh/gaussian/g09/g09/private:/home/lzzh/gaussian/g09/g09”:/home/lzzh/mpich2/bin)
....did not find Intel C compiler
....found GNU C compiler :/usr/bin/gcc
....found MPI C compiler :/usr/local/bin/mpicc

Do the options chosen above look OK? [ yes ]: y
... installing
.... creating Makefile

---- POLYRATE INSTALLATION COMPLETE ----

Have a nice day!

.... done with Makefile
顯示安裝完成，下面是測(cè)試過(guò)程：
[lzzh@HeavyOil ch5]$ ./ch5j1tr1.jc
gmake -s ../exe/polyrate2010-A.ch5.serial.exe
ivtstm.F:5681.72:

            pause 'singular matrix in gaussj'
                                                                     1
警告：已刪除的特性：(1)處的 PAUSE 語(yǔ)句
ivtstm.F:5701.72:

      if (a(icol,icol).eq.0.) pause 'singular matrix in gaussj'
                                                                     1
警告：已刪除的特性：(1)處的 PAUSE 語(yǔ)句
main.F:22: Error: Can't open included file 'mpif.h'
gmake[1]: *** [main.o] 錯(cuò)誤 1
gmake: *** [CH5S] 錯(cuò)誤 2
mv: 無(wú)法獲取"poly.fu1" 的文件狀態(tài)(stat): 沒(méi)有那個(gè)文件或目錄
mv: 無(wú)法獲取"poly.fu6" 的文件狀態(tài)(stat): 沒(méi)有那個(gè)文件或目錄
mv: 無(wú)法獲取"poly.fu14" 的文件狀態(tài)(stat): 沒(méi)有那個(gè)文件或目錄
mv: 無(wú)法獲取"poly.fu15" 的文件狀態(tài)(stat): 沒(méi)有那個(gè)文件或目錄
mv: 無(wú)法獲取"esp.fu61" 的文件狀態(tài)(stat): 沒(méi)有那個(gè)文件或目錄

結(jié)果就出現(xiàn)了上述過(guò)程中無(wú)法獲取相應(yīng)文件的問(wèn)題。 RP-VTST or VRC-VTST分別安裝，都遇到的同樣的問(wèn)題。自己整理了好久，也沒(méi)有解決。
各位大俠看是哪一步驟出了問(wèn)題，期待回復(fù)，謝謝！

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1樓 2012-12-29 20:41:04

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【答案】應(yīng)助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
zhongshidaxt: 金幣+10, ★有幫助, 我查出了是缺少intel編譯器的問(wèn)題，但是在linux ubuntu 系統(tǒng)上安裝不上intel的編譯器，所以到現(xiàn)在還是沒(méi)能成功安裝polyrate 2013-01-08 15:03:52
gmy1990: 金幣+2 2013-01-08 16:49:11

沒(méi)有 intel c 和 intel fortran compiler. 你去intel網(wǎng)站上下一個(gè)最新版的安裝一下。好像有2g大小。文件還是挺大的。

[ 發(fā)自手機(jī)版 http://www.gaoyang168.com/3g ]

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2樓2013-01-08 13:55:57

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3樓2013-01-08 17:50:41

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引用回帖:

3樓: Originally posted by flyingfish00 at 2013-01-08 17:50:41
建議這種計(jì)算還是用 redhat，或者cent os，據(jù)說(shuō)出錯(cuò)的情況很少。

我用的就是cent os，感覺(jué)各種軟件運(yùn)行還是挺順利的。

intel 編譯器現(xiàn)在改名 parallel_studio_xe_2013，自己到官網(wǎng)下載吧。要注冊(cè)一下的。...

intel編譯器我下下來(lái)了，并且服務(wù)器上的系統(tǒng)就是cent os 的，但是無(wú)法成功安裝

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4樓2013-01-08 18:49:04

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紫電

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【答案】應(yīng)助回帖

★ ★
gkf高: 金幣+2 2013-09-05 12:37:23

不知道你的問(wèn)題解決了沒(méi)有，2010—A有個(gè)小問(wèn)題，少了一個(gè)文件，你用2008安裝就OK了

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5樓2013-09-05 12:29:55

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