 |
 |
 |
 |
 |
 |
||
 |
 |
 |
 |
 |
| 3 | 1/1 | 返回列表 |
| 查看: 1701 | 回復(fù): 2 | |||
[求助]
ONIOM電荷設(shè)置問題
|
|
最近我在計(jì)算分子內(nèi)電荷轉(zhuǎn)移的問題，想利用高斯的layer來計(jì)算，準(zhǔn)備把一個(gè)分子分成三部分，這三部分都是QM的計(jì)算。 但是我看說明書一直沒明白其中的一些概念。最主要的是不知道怎么填寫電荷和自旋的那一欄。 說明書中是這么說的： Values and defaults for three-layer ONIOM calculations follow an analogous pattern (in the subscripts below, the first character is one of: Real, Int=Intermediate system, and Mod=Model system, and the second character is one of: H, M and L for the High, Medium and Low levels): cRealL sRealL [cIntM sIntM [cIntL sIntL [cModH sModH [cModM sModM [cModL sModL]]]]] 我能明白的就是這里的real system只的就是我們模擬的整個(gè)的體系，但是不明白那個(gè)Intermediate system 和Model system指的是什么，在網(wǎng)上搜了也沒找見，看文章的話估計(jì)得話很多時(shí)間才能明白，各位同仁能不能指點(diǎn)下呢？ 下面是我做的一個(gè)分子，分成三層，我想設(shè)置的是Low這層帶一個(gè)負(fù)電荷，M層帶一個(gè)正電荷，H層不帶電荷，總體也是不帶電荷的。大家覺得我應(yīng)該怎么設(shè)置呢？ %nprocshared=4 %chk=E:\cooperation\cnn\SYS-after.chk # oniom(b3lyp/6-31g(d):b3lyp/6-31g(d):b3lyp/6-31g(d)) sys -1 2 1 2 1 2 0 1 0 1 0 1 C 0 -5.80978800 -0.70835900 -0.98827500 M C 0 -4.69805200 -1.40248800 -0.56586200 M C 0 -3.53582800 -0.71606100 -0.12291700 M C 0 -3.53571800 0.71609900 -0.12332600 M C 0 -4.69780600 1.40245400 -0.56674200 M C 0 -5.80971100 0.70826300 -0.98858900 M C 0 -2.36897800 1.39771200 0.31449900 M C 0 -1.25423500 0.71369800 0.74485100 M H 14 C 0 -1.25430400 -0.71351500 0.74514700 M H 11 C 0 -2.36918700 -1.39760300 0.31527100 M C 0 -0.00000400 -1.41705800 1.22539400 H C 0 1.25418500 -0.71353900 0.74481600 L H 11 C 0 1.25427300 0.71367600 0.74486600 L H 14 C 0 0.00002100 1.41731600 1.22510900 H C 0 2.36922400 1.39767100 0.31501900 L C 0 3.53581900 0.71603300 -0.12313800 L C 0 3.53560200 -0.71612400 -0.12351900 L C 0 2.36889700 -1.39764100 0.31453400 L C 0 4.69768300 -1.40257200 -0.56679500 L C 0 5.80973100 -0.70846900 -0.98841600 L C 0 5.80993800 0.70814700 -0.98806800 L C 0 4.69811300 1.40236400 -0.56605000 L H 0 -6.69272400 -1.24575500 -1.32386400 M H 0 -4.69490400 -2.49020600 -0.56581300 M H 0 -4.69456200 2.49017000 -0.56712600 M H 0 -6.69249900 1.24560600 -1.32464900 M H 0 -2.36627500 2.48628700 0.30286100 M H 0 -2.36660200 -2.48618400 0.30411800 M H 0 0.00016800 -1.42797900 2.32895900 H H 0 -0.00008100 -2.46641500 0.91176500 H H 0 0.00001000 2.46660900 0.91129000 H H 0 0.00003700 1.42844500 2.32867700 H H 0 2.36673100 2.48625200 0.30387300 L H 0 2.36616200 -2.48621800 0.30304300 L H 0 4.69437800 -2.49028800 -0.56710200 L H 0 6.69264100 -1.24588400 -1.32404100 L H 0 6.69306500 1.24547000 -1.32327000 L H 0 4.69521300 2.49008100 -0.56558100 L |
回復(fù)此樓» 收錄本帖的淘帖專輯推薦
 過渡態(tài)計(jì)算 |
» 猜你喜歡
200年來人們一直無法破解的難題： 氣液臨界點(diǎn)狀態(tài)方程
已經(jīng)有7人回復(fù)
-
關(guān)于引力延遲下雙星系統(tǒng)角動(dòng)量不守恒的疑惑---求高手解答！
已經(jīng)有10人回復(fù)
-
物理化學(xué)論文潤色/翻譯怎么收費(fèi)?
已經(jīng)有219人回復(fù)
-
請(qǐng)問四氫呋喃溶解的聚合物用甲醇沉淀時(shí)，如何使沉淀過程加速？
已經(jīng)有2人回復(fù)
-
七嗪類物質(zhì)合成求助
已經(jīng)有0人回復(fù)
-
Chemical Bonding at Surfaces and Interfaces,最經(jīng)典的一本表面上化學(xué)相互作用教材
已經(jīng)有0人回復(fù)
-
誠邀有志之士加入江蘇大學(xué)環(huán)境學(xué)院合成生物學(xué)課題組！(長(zhǎng)期接收學(xué)碩專碩、碩博連讀)
已經(jīng)有16人回復(fù)
-
一志愿南大理論與計(jì)算化學(xué)方向（070300）342分，求調(diào)劑
已經(jīng)有1人回復(fù)
-
歡迎化學(xué)、化工、物理、材料、或計(jì)算機(jī)背景的考研咨詢
已經(jīng)有0人回復(fù)
» 本主題相關(guān)商家推薦: (我也要在這里推廣)
» 本主題相關(guān)價(jià)值貼推薦，對(duì)您同樣有幫助:
- ONIOM方法優(yōu)化分子篩結(jié)構(gòu)，出現(xiàn)NaN問題，9999錯(cuò)誤結(jié)束
已經(jīng)有5人回復(fù)
- 關(guān)于電荷密度分矢量設(shè)置問題
已經(jīng)有20人回復(fù)
- 怎樣設(shè)置有缺陷體系電荷問題
已經(jīng)有18人回復(fù)
- 【求助】在結(jié)構(gòu)中想讓N原子帶一個(gè)電荷該怎么設(shè)置？
已經(jīng)有4人回復(fù)
- 【求助】【求助】UFF方法計(jì)算吡啶咋分子篩上吸附時(shí)遇到的問題
已經(jīng)有5人回復(fù)
kaegi
金蟲 (小有名氣)
- 應(yīng)助: 9 (幼兒園)
- 金幣: 1405.6
- 紅花: 6
- 帖子: 276
- 在線: 87.4小時(shí)
- 蟲號(hào): 880820
- 注冊(cè): 2009-10-22
- 性別: GG
- 專業(yè): 物理有機(jī)化學(xué)
2樓2013-01-07 21:50:26
3樓2013-01-08 09:44:41
相關(guān)版塊跳轉(zhuǎn)
我要訂閱樓主 賀儀 的主題更新
| 3 | 1/1 | 返回列表 |
| 最具人氣熱帖推薦 [查看全部] | 作者 | 回/看 | 最后發(fā)表 | |
|---|---|---|---|---|
|
[考研] 286求調(diào)劑 +9 | Faune 2026-03-21 | 9/450 |
|
|---|---|---|---|---|
|
|
[考研] 280求調(diào)劑 +11 | 咕嚕曉曉 2026-03-18 | 12/600 |
|
|
|
[考研] 085600材料與化工306 +3 | z1z2z3879 2026-03-21 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 326求調(diào)劑 +5 | 諾貝爾化學(xué)獎(jiǎng)覬?/a> 2026-03-15 | 8/400 |
|
|
[考研] 一志愿南大，0703化學(xué)，分?jǐn)?shù)336，求調(diào)劑 +3 | 收到VS 2026-03-21 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 22 350 本科985求調(diào)劑，求老登收留 +3 | 李軼男003 2026-03-20 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 初始318分求調(diào)劑（有工作經(jīng)驗(yàn)） +3 | 1911236844 2026-03-17 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 一志愿中國石油大學(xué)（華東） 本科齊魯工業(yè)大學(xué) +3 | 石能偉 2026-03-17 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 一志愿華中科技大學(xué)，080502，354分求調(diào)劑 +5 | 守候夕陽CF 2026-03-18 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 294求調(diào)劑材料與化工專碩 +15 | 陌の森林 2026-03-18 | 15/750 |
|
|
|
[考研] 289求調(diào)劑 +6 | 懷瑾握瑜l 2026-03-20 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 一志愿南理工085701環(huán)境302求調(diào)劑院校 +3 | 葵梓衛(wèi)隊(duì) 2026-03-20 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 08工學(xué)調(diào)劑 +5 | 用戶573181 2026-03-20 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 085410人工智能專碩317求調(diào)劑（0854都可以） +4 | xbxudjdn 2026-03-18 | 4/200 |
|
|
|
[考研] 一志愿中國海洋大學(xué)，生物學(xué)，301分，求調(diào)劑 +5 | 1孫悟空 2026-03-17 | 6/300 |
|
|
|
[考研] 081700化工學(xué)碩調(diào)劑 +3 | 【1】 2026-03-16 | 3/150 |
|
|
|
[考博] 申博26年 +3 | 八6八68 2026-03-19 | 3/150 |
|
|
|
[考研] 東南大學(xué)364求調(diào)劑 +5 | JasonYuiui 2026-03-15 | 5/250 |
|
|
|
[考研] 333求調(diào)劑 +3 | 文思客 2026-03-16 | 7/350 |
|
|
|
[考研] 321求調(diào)劑 +5 | 大米飯！ 2026-03-15 | 5/250 |
|