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轉(zhuǎn)基因猴子木蟲 (正式寫手)
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[求助]
求助，是否有哪個(gè)蛋白質(zhì)三維軟件可以特定改變某個(gè)氨基酸的某個(gè)基團(tuán)
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| 本人想通過軟件改變某個(gè)特定氨基酸的某個(gè)基團(tuán)，比如說，我想改變某個(gè)位點(diǎn)的Lys的氨基，將其變?yōu)榱u基，有軟件可以做到這一點(diǎn)嗎？如何做的呀？PDBviewer pymal VMD能做嗎？請(qǐng)高手解答。50金幣送上.如能指導(dǎo)我順利做出，有更多金幣送上。 |
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9樓2013-01-22 08:46:05
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2樓2013-01-20 21:46:18
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【答案】應(yīng)助回帖
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chaizhm: 金幣+2, 謝謝~ 2013-01-21 08:17:07
轉(zhuǎn)基因猴子: 金幣+20 2013-01-21 13:51:38
chaizhm: 金幣+2, 謝謝~ 2013-01-21 08:17:07
轉(zhuǎn)基因猴子: 金幣+20 2013-01-21 13:51:38
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舉個(gè)例子。4dxd.pdb 175號(hào)殘基lys 的原子坐標(biāo)如下： ATOM 1133 N LYS A 175 4.266 20.656 -0.448 1.00 24.26 N ATOM 1134 CA LYS A 175 5.425 19.788 -0.168 1.00 24.34 C ATOM 1135 C LYS A 175 6.681 20.530 0.331 1.00 28.17 C ATOM 1136 O LYS A 175 7.509 19.928 1.005 1.00 28.22 O ATOM 1137 CB LYS A 175 5.745 18.901 -1.381 1.00 25.70 C ATOM 1138 CG LYS A 175 4.648 17.890 -1.613 1.00 25.52 C ATOM 1139 CD LYS A 175 4.955 16.904 -2.714 1.00 28.78 C ATOM 1140 CE LYS A 175 3.767 15.995 -2.930 1.00 33.76 C ATOM 1141 NZ LYS A 175 3.995 15.043 -4.046 1.00 46.97 N 把 1141 的NZ改成如下 ATOM 1141 O LYS A 175 3.995 15.043 -4.046 1.00 46.97 O 然后你用一些軟件加氫，就將氨基改成了羥基。但是這種改變是否有科學(xué)依據(jù)？你需要自己判斷。 |
3樓2013-01-20 21:56:34
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4樓2013-01-21 13:51:28
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5樓2013-01-21 15:02:42
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10樓2013-01-22 11:59:30
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