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962162633金蟲 (小有名氣)
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[求助]
Pymol分析對接后的pdb文件
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| 使用Pymol分析蛋白質(zhì)與蛋白質(zhì)相互作用位置,顯示出相互作用的殘基、以及氫鍵作用等,圖片效果在附件中。用Pymol能做出附件所示圖片嗎?之前沒有做過,敬請各位大蝦指點。。≈x謝! |
VMD 軟件 | 分子模擬要術(shù) | pymol/VMD/Origin |
銀蟲 (小有名氣)
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文字可以保存圖片之后再加上。至于圖嘛,先按照在顯示界面右側(cè)對應(yīng)的object的A-preset-publication,顯示界面右下角有個S可以把序列調(diào)出來,按照你需要的選擇序列,顯示界面對應(yīng)的object旁邊C可以改變顏色,S顯示不同的模式,你選擇好要顯示成surface的部分序列后按照S-surface,再在控制界面中Setting-transparency-surface-20%就好了。 至于距離可以在控制界面wizard-measurement中,量出來就好了。 如果需要還可以設(shè)置一下光線讓圖片更好看些。 |
金蟲 (小有名氣)
榮譽版主 (著名寫手)
保密局的……

金蟲 (小有名氣)
銀蟲 (小有名氣)
| http://good.gd/2416359.htm給你做了幾張簡單截圖,你試試吧,再不行只能看看教程了,這個教程里都有。 |
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