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Siesta基組問題
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新手最近學(xué)習(xí)Siesta，自己寫了個(gè)輸入文件，運(yùn)行之后報(bào)錯(cuò)如下： Reading pseudopotential information in formatted form from O.psf Valence configuration for pseudopotential generation: 2s( 2.00) rc: 1.14 2p( 4.00) rc: 1.14 3d( 0.00) rc: 1.14 4f( 0.00) rc: 1.14 Ground state valence configuration: 4s02 3d10Need vcte and rinn after E in PAO.Basis ERROR STOP from Node: 0 Reading pseudopotential information in formatted form from Zn.psf Valence configuration for pseudopotential generation: 4s( 2.00) rc: 2.43 4p( 0.00) rc: 2.37 3d(10.00) rc: 2.09 4f( 0.00) rc: 2.82 Semicore shell(s) with -1 electrons included in the valence for O Need vcte and rinn after E in PAO.Basis ERROR STOP from Node: 0 -------------------------------------------------------------------------- 輸入文件如下： SystemName st1 SystemLabel znO NumberOfAtoms 60 NumberOfSpecies 2 %block ChemicalSpeciesLabel 1 9 O 2 30 Zn %endblock ChemicalSpeciesLabel LatticeConstant 1.0000 Ang %block LatticeVectors 25.99752 0.000 0.000 0.000 25.98764 0.000 0.000 0.000 5.69196 %endblock LatticeVectors PAO.EnergyShift 200 mev PAO.BasisSize SZ %block PAO.Basis # Define Basis set O 2 1.0 # Label, l_shells, type (opt), ionic_charge (opt) n=2 0 2 E 1 # n (opt if not using semicore levels),l,Nzeta,Softconf(opt 0.0 0.0 # rc(izeta=1,Nzeta)(Bohr) n=2 1 1 P 2 # l, Nzeta, PolOrb (opt), NzetaPol (opt) 0.0 0.0 # rc(izeta=1,Nzeta)(Bohr) %endblock PAO.Basis XC.functional GGA XC.authors PBE MeshCutoff 40.0 Ry %block kgrid_Monkhorst_Pack 1 0 0 0.0 0 1 0 0.0 0 0 18 0.0 %endblock Kgrid_Monkhorst_Pack MeshCutoff 100.0 Ry MaxSCFIterations 200 DM.MixingWeight 0.05 DM.NumberPulay 3 DM.Tolerance 1.d-4 SolutionMethod diagon WriteBands true BandLinesScale ReciprocalLatticeVectors %block BandLines 1 0.000 0.000 0.000 \Gamma 40 0.000 0.000 0.500 X %endblock BandLines MD.TypeOfRun cg MD.NumCGsteps 0 MD.MaxForceTol 0.02 eV/Ang MD.VariableCell true # MD.UseSaveXV true # UseSaveData true Diag.ParallelOverK true AtomicCoordinatesFormat Ang %block AtomicCoordinatesAndAtomicSpecies 0.61455 0.21815 0.35802 1 # O 1 0.66997 0.24952 0.85805 1 # O 2 0.71780 0.29113 0.35780 1 # O 3 0.75720 0.34127 0.85771 1 # O 4 0.78453 0.39859 0.35752 1 # O 5 0.79987 0.46049 0.85762 1 # O 6 0.80031 0.52406 0.35764 1 # O 7 0.49044 0.19376 0.35745 1 # O 8 0.55374 0.19983 0.85780 1 # O 9 0.36771 0.22441 0.35728 1 # O 10 0.42714 0.20135 0.85741 1 # O 11 0.31448 0.25918 0.85713 1 # O 12 0.26878 0.30358 0.35716 1 # O 13 0.23197 0.35539 0.85738 1 # O 14 0.20661 0.41389 0.35754 1 # O 15 0.19570 0.47657 0.85728 1 # O 16 0.78725 0.58641 0.85751 1 # O 17 0.76264 0.64502 0.35760 1 # O 18 0.72739 0.69805 0.85785 1 # O 19 0.68227 0.74289 0.35818 1 # O 20 0.56712 0.79523 0.35794 1 # O 21 0.62792 0.77629 0.85817 1 # O 22 0.44053 0.79624 0.35744 1 # O 23 0.50386 0.80132 0.85765 1 # O 24 0.19667 0.54015 0.35725 1 # O 25 0.20906 0.60248 0.85744 1 # O 26 0.23416 0.66101 0.35759 1 # O 27 0.27236 0.71199 0.85751 1 # O 28 0.32188 0.75213 0.35740 1 # O 29 0.37921 0.77968 0.85733 1 # O 30 0.61346 0.22093 0.02461 2 # Zn 31 0.66841 0.25155 0.52456 2 # Zn 32 0.71625 0.29291 0.02421 2 # Zn 33 0.75460 0.34276 0.52419 2 # Zn 34 0.78223 0.39957 0.02394 2 # Zn 35 0.79676 0.46078 0.52421 2 # Zn 36 0.79764 0.52388 0.02415 2 # Zn 37 0.49040 0.19648 0.02388 2 # Zn 38 0.55323 0.20214 0.52426 2 # Zn 39 0.36898 0.22674 0.02369 2 # Zn 40 0.42798 0.20467 0.52395 2 # Zn 41 0.31594 0.26112 0.52346 2 # Zn 42 0.27055 0.30495 0.02345 2 # Zn 43 0.23431 0.35678 0.52383 2 # Zn 44 0.20978 0.41477 0.02413 2 # Zn 45 0.19808 0.47677 0.52374 2 # Zn 46 0.78499 0.58565 0.52392 2 # Zn 47 0.76050 0.64392 0.02398 2 # Zn 48 0.72547 0.69637 0.52428 2 # Zn 49 0.68037 0.74057 0.02466 2 # Zn 50 0.56665 0.79272 0.02437 2 # Zn 51 0.62657 0.77319 0.52474 2 # Zn 52 0.44094 0.79390 0.02389 2 # Zn 53 0.50383 0.79918 0.52403 2 # Zn 54 0.19892 0.53989 0.02367 2 # Zn 55 0.21168 0.60171 0.52394 2 # Zn 56 0.23687 0.65944 0.02412 2 # Zn 57 0.27475 0.70975 0.52407 2 # Zn 58 0.32353 0.74947 0.02392 2 # Zn 59 0.37999 0.77753 0.52373 2 # Zn 60 %endblock AtomicCoordinatesAndAtomicSpecies 各位幫幫忙啊。版內(nèi)的帖子也看了不少，還是不明白這個(gè)半芯態(tài)如何設(shè)置。設(shè)置的時(shí)候是基于什么原理，有什么講究。 |
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2樓2013-02-20 15:33:22
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