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vallen

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[求助] 為什么pwscf單節(jié)點8核運行比1個核還要慢?

我用單節(jié)點,8核運行pw.x
mpirun -n 8 ./pw.x -input xx.in > log

察看了一下，cpu占用率都只有50%左右，
看了一下log文件，里面很多重復(fù)的內(nèi)容，好像每個cpu都在各算各的，根本沒有并行
這樣還不如只用一個核心快

是不是我的命令有問題
怎么讓單機8核并行呢

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1樓 2013-02-26 00:48:16

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souledge

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【答案】應(yīng)助回帖

★ ★
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
vallen: 金幣+2 2013-02-27 10:47:55

說明編譯的PWscf可能只是串行版～如果成功編譯成了并行可執(zhí)行文件，執(zhí)行后的文件開頭應(yīng)該是：

引用回帖:

   Program PWSCF v.5.0.2 (svn rev. 9392) starts on  3Jan2013 at  1:42:26

   This program is part of the open-source Quantum ESPRESSO suite
   for quantum simulation of materials; please cite
      "P. Giannozzi et al., J. Phys.:Condens. Matter 21 395502 (2009);
      URL http://www.quantum-espresso.org",
   in publications or presentations arising from this work. More details at
   http://www.quantum-espresso.org/quote.php

   Parallel version (MPI), running on    6 processors
   R & G space division:  proc/nbgrp/npool/nimage =    6

并且文件內(nèi)容不會有重復(fù)。

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思想重于技巧，內(nèi)涵重于表象

2樓2013-02-26 10:53:32

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729267452lgl

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【答案】應(yīng)助回帖

★ ★ ★
感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
vallen: 金幣+3 2013-02-27 10:47:59

你是不是沒有安裝并行的程序，所以沒有并行。再說如果單個核就很快計算的東西，如果用8個核肯定要慢，因為核多的話需要給每個核分配任務(wù)，這也需要很長時間。

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3樓2013-02-26 16:57:13

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vallen

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引用回帖:

2樓: Originally posted by souledge at 2013-02-26 10:53:32
說明編譯的PWscf可能只是串行版～如果成功編譯成了并行可執(zhí)行文件，執(zhí)行后的文件開頭應(yīng)該是：

并且文件內(nèi)容不會有重復(fù)。...

是并行版本，我的開頭是這樣的，只用一個節(jié)點進行計算
，開始就有很多重復(fù)的內(nèi)容

WARNING: Unable to read mpd.hosts or list of hosts isn't provided. MPI job will be run on the current machine only.

   Program PWSCF v.5.0.2 (svn rev. 9392) starts on 25Feb2013 at 14:37:24

   This program is part of the open-source Quantum ESPRESSO suite
   for quantum simulation of materials; please cite
      "P. Giannozzi et al., J. Phys.:Condens. Matter 21 395502 (2009);
      URL http://www.quantum-espresso.org",
   in publications or presentations arising from this work. More details at
   http://www.quantum-espresso.org/quote.php

   Parallel version (MPI), running on    1 processors

   Current dimensions of program PWSCF are:
   Max number of different atomic species (ntypx) = 10
   Max number of k-points (npk) =  40000
   Max angular momentum in pseudopotentials (lmaxx) =  3
   Reading input from pt.2.in

   Program PWSCF v.5.0.2 (svn rev. 9392) starts on 25Feb2013 at 14:37:24

   This program is part of the open-source Quantum ESPRESSO suite
   for quantum simulation of materials; please cite
      "P. Giannozzi et al., J. Phys.:Condens. Matter 21 395502 (2009);
      URL http://www.quantum-espresso.org",
   in publications or presentations arising from this work. More details at
   http://www.quantum-espresso.org/quote.php

   Parallel version (MPI), running on    1 processors
底下還有很多重復(fù)

好像就是8個核算得同樣的東西都放在了一個文件里

這是怎么回事，難道單節(jié)點不能多核運行嗎

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4樓2013-02-26 18:46:42

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找到方法了，用openmp重新進行編譯就好了
openmp就是用來多線程計算的

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5樓2013-02-27 10:46:42

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txwang

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Your problem is not wholly solved. There is some problem in your compilation with MPI!!!

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6樓2014-04-04 21:33:09

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lesite

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引用回帖:

5樓: Originally posted by vallen at 2013-02-27 10:46:42
找到方法了，用openmp重新進行編譯就好了
openmp就是用來多線程計算的

你這個是編譯的串行多線程版的吧我之前編譯是并行版的運行例子都正常，但一做任務(wù)就報錯。還有對于單CPU多核計算機是否只能正常運行串行版本？并行是多CPU才有意義吧？

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7樓2015-03-11 19:08:35

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引用回帖:

6樓: Originally posted by txwang at 2014-04-04 21:33:09
Your problem is not wholly solved. There is some problem in your compilation with MPI!!!

具體會是什么問題？我之前編譯并行版也遇到類似的問題，打開程序顯示是并行版本，運行示例沒有問題，但一運行任務(wù)就顯示psedo file找不到，又或者等待input文件。。。

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8樓2015-03-11 19:10:50

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