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[求助] 為什么pwscf單節(jié)點(diǎn)8核運(yùn)行比1個(gè)核還要慢?

我用單節(jié)點(diǎn),8核運(yùn)行pw.x
mpirun -n 8 ./pw.x -input xx.in > log

察看了一下，cpu占用率都只有50%左右，
看了一下log文件，里面很多重復(fù)的內(nèi)容，好像每個(gè)cpu都在各算各的，根本沒有并行
這樣還不如只用一個(gè)核心快

是不是我的命令有問(wèn)題
怎么讓單機(jī)8核并行呢

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1樓 2013-02-26 00:48:16

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souledge

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vallen: 金幣+2 2013-02-27 10:47:55

說(shuō)明編譯的PWscf可能只是串行版～如果成功編譯成了并行可執(zhí)行文件，執(zhí)行后的文件開頭應(yīng)該是：

引用回帖:

   Program PWSCF v.5.0.2 (svn rev. 9392) starts on  3Jan2013 at  1:42:26

   This program is part of the open-source Quantum ESPRESSO suite
   for quantum simulation of materials; please cite
      "P. Giannozzi et al., J. Phys.:Condens. Matter 21 395502 (2009);
      URL http://www.quantum-espresso.org",
   in publications or presentations arising from this work. More details at
   http://www.quantum-espresso.org/quote.php

   Parallel version (MPI), running on    6 processors
   R & G space division:  proc/nbgrp/npool/nimage =    6

并且文件內(nèi)容不會(huì)有重復(fù)。

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思想重于技巧，內(nèi)涵重于表象

2樓2013-02-26 10:53:32

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729267452lgl

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【答案】應(yīng)助回帖

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vallen: 金幣+3 2013-02-27 10:47:59

你是不是沒有安裝并行的程序，所以沒有并行。再說(shuō)如果單個(gè)核就很快計(jì)算的東西，如果用8個(gè)核肯定要慢，因?yàn)楹硕嗟脑捫枰o每個(gè)核分配任務(wù)，這也需要很長(zhǎng)時(shí)間。

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3樓2013-02-26 16:57:13

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vallen

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引用回帖:

2樓: Originally posted by souledge at 2013-02-26 10:53:32
說(shuō)明編譯的PWscf可能只是串行版～如果成功編譯成了并行可執(zhí)行文件，執(zhí)行后的文件開頭應(yīng)該是：

并且文件內(nèi)容不會(huì)有重復(fù)。...

是并行版本，我的開頭是這樣的，只用一個(gè)節(jié)點(diǎn)進(jìn)行計(jì)算
，開始就有很多重復(fù)的內(nèi)容

WARNING: Unable to read mpd.hosts or list of hosts isn't provided. MPI job will be run on the current machine only.

   Program PWSCF v.5.0.2 (svn rev. 9392) starts on 25Feb2013 at 14:37:24

   This program is part of the open-source Quantum ESPRESSO suite
   for quantum simulation of materials; please cite
      "P. Giannozzi et al., J. Phys.:Condens. Matter 21 395502 (2009);
      URL http://www.quantum-espresso.org",
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   Parallel version (MPI), running on    1 processors

   Current dimensions of program PWSCF are:
   Max number of different atomic species (ntypx) = 10
   Max number of k-points (npk) =  40000
   Max angular momentum in pseudopotentials (lmaxx) =  3
   Reading input from pt.2.in

   Program PWSCF v.5.0.2 (svn rev. 9392) starts on 25Feb2013 at 14:37:24

   This program is part of the open-source Quantum ESPRESSO suite
   for quantum simulation of materials; please cite
      "P. Giannozzi et al., J. Phys.:Condens. Matter 21 395502 (2009);
      URL http://www.quantum-espresso.org",
   in publications or presentations arising from this work. More details at
   http://www.quantum-espresso.org/quote.php

   Parallel version (MPI), running on    1 processors
底下還有很多重復(fù)

好像就是8個(gè)核算得同樣的東西都放在了一個(gè)文件里

這是怎么回事，難道單節(jié)點(diǎn)不能多核運(yùn)行嗎

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4樓2013-02-26 18:46:42

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找到方法了，用openmp重新進(jìn)行編譯就好了
openmp就是用來(lái)多線程計(jì)算的

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5樓2013-02-27 10:46:42

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txwang

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Your problem is not wholly solved. There is some problem in your compilation with MPI!!!

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6樓2014-04-04 21:33:09

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lesite

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引用回帖:

5樓: Originally posted by vallen at 2013-02-27 10:46:42
找到方法了，用openmp重新進(jìn)行編譯就好了
openmp就是用來(lái)多線程計(jì)算的

你這個(gè)是編譯的串行多線程版的吧我之前編譯是并行版的運(yùn)行例子都正常，但一做任務(wù)就報(bào)錯(cuò)。還有對(duì)于單CPU多核計(jì)算機(jī) 是否只能正常運(yùn)行串行版本？并行是多CPU才有意義吧？

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7樓2015-03-11 19:08:35

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lesite

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引用回帖:

6樓: Originally posted by txwang at 2014-04-04 21:33:09
Your problem is not wholly solved. There is some problem in your compilation with MPI!!!

具體會(huì)是什么問(wèn)題？我之前編譯并行版也遇到類似的問(wèn)題，打開程序顯示是并行版本，運(yùn)行示例沒有問(wèn)題，但一運(yùn)行任務(wù)就顯示psedo file找不到，又或者等待input文件。。。

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8樓2015-03-11 19:10:50

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