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MS 進(jìn)行溶液分子動(dòng)力學(xué)計(jì)算時(shí)在哪里設(shè)置力場參數(shù)
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| 看到文獻(xiàn)上各種溶液中分子離子的力場參數(shù),不知道具體在MS的哪個(gè)位置設(shè)置,新手求指教啊 |
材料綜合及計(jì)算模擬 |
銅蟲 (正式寫手)
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在MS的HELP里面有一個(gè)教程是教人如何修改添加力場參數(shù)的,可以參閱里面的介紹,自己添加。 其實(shí)如果對(duì)分子動(dòng)力學(xué)和力場形式有一定了解的話,你完全可以新建個(gè)力場,在里面指定所要研究體系的非鍵和成鍵作用參數(shù)以及作用勢函數(shù)形式,基本上MS的HELP手冊(cè)里面對(duì)力場的作用形式定義的也算比較好,你看過以后,相信可以成功。 附:我也只是對(duì)MS的力場有淺顯的了解,畢竟沒有那它做過比較完善的計(jì)算,如果沒有強(qiáng)大計(jì)算平臺(tái)的話,不建議采用MS的MD做研究,但是如果只想和實(shí)驗(yàn)對(duì)比的話則另當(dāng)別論。 祝成功 |
銅蟲 (正式寫手)
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