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心蕊rxr木蟲 (小有名氣)
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[求助]
小女子比較菜,希望各位大俠詳細描述,在此先謝過!
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各位大俠,請教cif中各類錯誤應該如何修改,小女子比較菜,希望各位大俠詳細描述,在此先謝過啊,多謝多謝! PLAT220_ALERT_2_B Large Non-Solvent C Ueq(max)/Ueq(min) ... 5.7 Ratio PLAT213_ALERT_2_C Atom C18 has ADP max/min Ratio ..... 3.9 prola PLAT222_ALERT_3_C Large Non-Solvent H Uiso(max)/Uiso(min) .. 6.5 Ratio PLAT774_ALERT_1_C Suspect X-Y Bond in CIF: EU2 -- EU2 .. 3.93 Ang. |
至尊木蟲 (知名作家)
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你的這2個C類問題已經(jīng)不是錯誤了,你把它們看得太嚴重了。 PLAT342_ALERT_3_C Low Bond Precision on C-C Bonds ............... 0.0084 Ang PLAT774_ALERT_1_C Suspect X-Y Bond in CIF: EU2 -- EU2 .. 3.93 Ang 請看checkcif上關于C類問題的注解:ALERT level C = Check. Ensure it is not caused by an omission or oversight 其實許多C類問題僅僅是提出一些事實,引起你注意一下,讓你檢查一下是否有疏忽或者筆誤,如果你沒有疏忽或者筆誤,就不需要修改它們,很正常。投稿時候編輯是不會問你這2個問題的。我是研究稀土的,知道EU2 -- EU2 .. 3.93 Ang是會發(fā)生的,不是錯誤。 |

至尊木蟲 (知名作家)
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我試著回答你的這些問題。首先你的這些結構問題都不算嚴重,如果不是投結構類的期刊應該沒有什么問題。 PLAT220_ALERT_2_B Large Non-Solvent C Ueq(max)/Ueq(min) ... 5.7 Ratio 可以嘗試使用指令:simu 0.02 0.02 $C (前一個0.02 數(shù)值可以小幅改變,你自己嘗試來做。后一個0.02 是誤差,不需要改動。) PLAT213_ALERT_2_C Atom C18 has ADP max/min Ratio ..... 3.9 prola 可以嘗試使用指令:isor 0.01 C18 (0.01可以變化到0.001,根據(jù)需要來進行改變。 ) PLAT222_ALERT_3_C Large Non-Solvent H Uiso(max)/Uiso(min) .. 6.5 Ratio 如果是配位水上頭的氫原子出現(xiàn)問題,請把ins文件中的H原子后面的熱參數(shù)修改為-1.20000然后在精修。 PLAT774_ALERT_1_C Suspect X-Y Bond in CIF: EU2 -- EU2 .. 3.93 Ang. 這個表明相鄰的EU2 -- EU2比較短,實際上是正常的,不需要理會。你可以查一下這方面的文獻,如果有發(fā)現(xiàn)稀土離子之間的距離在3.93 Ang就說明這個結果是正確的。當然即使沒有相關的報道,你的這個結構中EU2 -- EU2 .. 3.93 Ang也不錯誤。 回答到此,拋磚引玉,其他的高手可能有更好的方法請指教。 |

木蟲 (小有名氣)
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哇,大俠回答的太詳細了,第一個錯誤我按您給的指令錯誤還沒有消除,后來我逐漸減小數(shù)值,變?yōu)閟imu 0.003 0.003 $C之后錯誤沒有了,同時第二、第三個錯誤也消失了,不過又出現(xiàn)了另一個錯誤PLAT342_ALERT_3_C Low Bond Precision on C-C Bonds ............... 0.0084 Ang ,是因為我把值改的太小了嗎,可是不該笑還是會有錯誤;還有PLAT774_ALERT_1_C Suspect X-Y Bond in CIF: EU2 -- EU2 .. 3.93 Ang. 這個錯誤要是消除有沒有消除的辦法呢?希望大俠您再次應助,感激不盡! |
木蟲 (小有名氣)
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