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最后的張起靈新蟲(chóng) (初入文壇)
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[求助]
GAMESS求助
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首先聲明我是新手.....關(guān)于GAMESS里DATA CS對(duì)稱(chēng)性怎么輸入。窟有 GAMESS程序是怎么反演的?為什么我輸入三個(gè)原子坐標(biāo) cs對(duì)稱(chēng)性 可是卻反演出5個(gè)原子?謝大神指教! |
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CS對(duì)稱(chēng)性就寫(xiě)CS就好。如果如下寫(xiě)法: $DATA AAA CS A ..... $END CS后面跟著空行的話,表示以GAMESS默認(rèn)的對(duì)稱(chēng)面(XY平面)進(jìn)行推演。只要將你的體系的坐標(biāo)按照這個(gè)要求去寫(xiě)就行。你的問(wèn)題可能是對(duì)稱(chēng)面沒(méi)放在XY平面上導(dǎo)致的。如果希望不按照默認(rèn)的XY平面對(duì)稱(chēng)的話,需要在CS下給出三個(gè)坐標(biāo)(占兩行,第一行兩個(gè)坐標(biāo),第二行一個(gè)坐標(biāo)),通過(guò)三個(gè)坐標(biāo)給出對(duì)稱(chēng)面。能按照默認(rèn)的來(lái)的就按照默認(rèn)的吧,寫(xiě)起來(lái)也簡(jiǎn)單不是么? 如果覺(jué)得麻煩的話,還有一個(gè)辦法: $CONTRL COORD=PRINAXIS $END 利用PRINAXIS關(guān)鍵字,在$DATA中指明CS對(duì)稱(chēng)性并給出全部原子的坐標(biāo),GAMESS會(huì)自動(dòng)將你的體系的坐標(biāo)調(diào)整到標(biāo)準(zhǔn)格式并給出對(duì)稱(chēng)性上獨(dú)立的原子,只要你的體系具備CS對(duì)稱(chēng)性。 |


新蟲(chóng) (初入文壇)
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