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最后的張起靈新蟲 (初入文壇)
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[求助]
GAMESS求助
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首先聲明我是新手.....關(guān)于GAMESS里DATA CS對(duì)稱性怎么輸入��？還有 GAMESS程序是怎么反演的？為什么我輸入三個(gè)原子坐標(biāo) cs對(duì)稱性 可是卻反演出5個(gè)原子？謝大神指教��！ |
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【答案】應(yīng)助回帖
★ ★ ★
gmy1990: 金幣+3 2013-03-19 09:33:49
gmy1990: 金幣+3 2013-03-19 09:33:49
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CS對(duì)稱性就寫CS就好。如果如下寫法： $DATA AAA CS A ..... $END CS后面跟著空行的話，表示以GAMESS默認(rèn)的對(duì)稱面（XY平面）進(jìn)行推演。只要將你的體系的坐標(biāo)按照這個(gè)要求去寫就行。你的問題可能是對(duì)稱面沒放在XY平面上導(dǎo)致的。如果希望不按照默認(rèn)的XY平面對(duì)稱的話，需要在CS下給出三個(gè)坐標(biāo)（占兩行，第一行兩個(gè)坐標(biāo)，第二行一個(gè)坐標(biāo)），通過三個(gè)坐標(biāo)給出對(duì)稱面。能按照默認(rèn)的來的就按照默認(rèn)的吧，寫起來也簡(jiǎn)單不是么？ 如果覺得麻煩的話，還有一個(gè)辦法： $CONTRL COORD=PRINAXIS $END 利用PRINAXIS關(guān)鍵字，在$DATA中指明CS對(duì)稱性并給出全部原子的坐標(biāo)，GAMESS會(huì)自動(dòng)將你的體系的坐標(biāo)調(diào)整到標(biāo)準(zhǔn)格式并給出對(duì)稱性上獨(dú)立的原子，只要你的體系具備CS對(duì)稱性。 |
2樓2013-03-18 22:12:31
3樓2013-03-18 22:13:10
最后的張起靈
新蟲 (初入文壇)
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4樓2013-03-21 23:07:20
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