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welles.fong鐵蟲 (初入文壇)
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[求助]
打開由AMBER創(chuàng)建的pdb文件出現(xiàn)問題
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各位大神，小弟之前看一篇文章講AMBER模擬的。小弟比較感興趣，就想拿個由AMBER創(chuàng)建出來的pdb文件來玩玩。但將那些supporting information入邊提供的坐標(biāo)值貼到記事本，存成pdb文件后再打開卻發(fā)現(xiàn)打不開。用PDBViewer、Sybyl和AMBER都打不開。 小弟以為是對得不齊整，就用tab鍵將那些坐標(biāo)值全部對齊再開，一樣打不開。將當(dāng)中“RC”改成“C”也無效。 一番努力依舊無果，于是向各位大神求助。急，謝！ 原文：The Nuclear Magnetic Resonance of CCCC RNA Reveals a Right-Handed Helix, and Revised Parameters for AMBER Force Field Torsions Improve Structural Predictions from Molecular Dynamics, Biochemistry, 2013, 52 (6), pp 996–1010, DOI: 10.1021/bi3010347 附上此文supporting info及我復(fù)制到記事本后存的pdb文件供大家參考。 |
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- 附件 2 : rC4.pdb
2013-03-17 21:55:42, 7.31 M
2013-03-17 21:55:54, 4.74 K
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welles.fong
鐵蟲 (初入文壇)
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5樓2013-03-18 12:37:39
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