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北京石油化工學(xué)院2026年研究生招生接收調(diào)劑公告

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zxy964777869

銅蟲 (正式寫手)

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專業(yè): 理論和計(jì)算化學(xué)

[求助] discover分析擴(kuò)散系數(shù)求問

discover可以通過通過均方位移，再結(jié)合愛因斯坦擴(kuò)散方程可以得到分子擴(kuò)散率，但是有一個(gè)疑問，discover分析均方位移的時(shí)候有沒有去掉周期性條件，眾所周知，在施加了周期性邊界條件的體系，分析均方位移的時(shí)候要去除周期性條件，有沒有大俠可以出來解釋一下discover中對(duì)pbc的處理，是否在discover分析的時(shí)候已經(jīng)刨除了PBC的影響。

最近用discover算了一個(gè)體系，先NVT，后NPT，最后NVE，最后NVE的勢(shì)能曲線如圖，可知體系已經(jīng)達(dá)到了平衡，但是用discover分析MSD，得到的曲線則是不規(guī)則的，這難道是我的體系的原因么，由這樣的曲線可以計(jì)算擴(kuò)散系數(shù)么？謝謝

MSD曲線.jpg

勢(shì)能曲線.jpg

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1樓 2013-03-21 20:14:37

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