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柳譽(yù)鐵蟲 (小有名氣)
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[求助]
Gaussian結(jié)構(gòu)優(yōu)化問(wèn)題�。。�
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我是Gaussian的初學(xué)者，經(jīng)驗(yàn)欠缺，懇請(qǐng)各位前輩賜教！ 我對(duì)一個(gè)分子量為250多的分子進(jìn)行結(jié)構(gòu)優(yōu)化和頻率計(jì)算，可是最后得到的優(yōu)化結(jié)構(gòu)與一些外國(guó)網(wǎng)站和Chem3D中minimize energy操作后的結(jié)構(gòu)有大的區(qū)別：高斯得出的結(jié)構(gòu)各原子幾乎都在一個(gè)平面上，而后者能明顯看出環(huán)之間有一個(gè)近50度的夾角。 計(jì)算設(shè)置參數(shù)如下 Method: Ground State DFT... Restricted B3LYP Basis Set: 6-31G d Charge: 0 spin: Singlet （# opt freq=noraman rb3lyp/6-31g(d) geom=connectivity） |
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柳譽(yù)
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可是有些外國(guó)網(wǎng)站的給出的3D模型是和Chem3D的更接近，比如 http://www.chemicalize.org/ http://www.chemspider.com/ http://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/ 等網(wǎng)站所提供的3D模型。我不知道這些網(wǎng)站提供的信息可信度如何，但他們所提供的模型看，還是有一定的一致性，這樣應(yīng)該不會(huì)只是偶然吧？ |
3樓2013-03-22 13:13:51
2樓2013-03-22 10:57:12
stalart
木蟲 (正式寫手)
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4樓2013-03-22 19:09:04
柳譽(yù)
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5樓2013-03-22 20:02:12
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