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lgc020305銀蟲(chóng) (正式寫手)
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老板說(shuō)G09做UV-vis模擬直接依據(jù)氣態(tài)優(yōu)化構(gòu)型計(jì)算?、、??
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如題,老板說(shuō)做UV-vis模擬要直接依據(jù)氣態(tài)下的優(yōu)化結(jié)構(gòu),不能用溶劑模型的優(yōu)化結(jié)構(gòu)進(jìn)行TD計(jì)算,這樣對(duì)嗎?我不是很贊同。 求大俠解釋。 以老板的說(shuō)法:step1. # opt freq scf(conver=7,maxcyc=256) step 2. #pbepbe/6-31g(d) td(nstates=50) scrf(smd,solvent=water) 為什么step1不是# opt freq scf(conver=7,maxcyc=256) scrf(smd,solvent=water) 老板的意思好像是用scrf只是一個(gè)模型,并不表示在溶劑中優(yōu)化。 他堅(jiān)持用氣態(tài)優(yōu)化結(jié)構(gòu)計(jì)算UV-vis。 我說(shuō)用氣態(tài)優(yōu)化結(jié)構(gòu)計(jì)算UV-vis是錯(cuò)的,他很生氣。 問(wèn)題是:UV-vis模擬時(shí),構(gòu)型到底用不用scrf溶劑模型優(yōu)化?還是直接使用氣態(tài)優(yōu)化好的結(jié)構(gòu)? |
模擬計(jì)算 |
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鐵桿木蟲(chóng) (職業(yè)作家)
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老板的意思好像是用scrf只是一個(gè)模型,并不表示在溶劑中優(yōu)化!銈兝习暹停留在G03的認(rèn)識(shí)上,那個(gè)時(shí)候的SCRF確實(shí)對(duì)于優(yōu)化不太理想,G09改善了,溶劑中的優(yōu)化更合理,梯度計(jì)算更好。 他堅(jiān)持用氣態(tài)優(yōu)化結(jié)構(gòu)計(jì)算UV-vis!@個(gè)也不一定是錯(cuò)的,前幾年限于計(jì)時(shí),認(rèn)為溶劑對(duì)幾何影響很小,所以首選就是去氣相的幾何。 我說(shuō)用氣態(tài)優(yōu)化結(jié)構(gòu)計(jì)算UV-vis是錯(cuò)的,他很生氣!阏f(shuō)老板是錯(cuò)的,能不生氣嗎?要說(shuō)的委婉一些。你的觀點(diǎn)是對(duì)的,在溶液中測(cè)得UV,當(dāng)然符合實(shí)際的就是溶液中優(yōu)化幾何,然后溶液中TD。 額外話:不要說(shuō)老板是錯(cuò)的,要委婉輸出老板的觀點(diǎn)是不合適的。 |
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木蟲(chóng) (著名寫手)
銀蟲(chóng) (正式寫手)
木蟲(chóng) (著名寫手)
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你老板也有些太固執(zhí)了。即使算了,將來(lái)也可以放到文章中討論,浪費(fèi)不了多大時(shí)間。 實(shí)際上,近些年的工作中,相當(dāng)多的人在計(jì)算溶液中的能量時(shí)都是在氣相下優(yōu)化的,不會(huì)再在溶液中重新優(yōu)化結(jié)構(gòu)(Chem. Eur. J. 2012, 18, 9955 – 9964)。溶液下重新優(yōu)化的也有,但比較少( Chem. Eur. J. 2011, 17, 5060 – 5067)。 |
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