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zhsp07金蟲(chóng) (小有名氣)
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[求助]
DNAMAN拼接序列如何保存為線性序列？
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華大測(cè)序的16S 未給拼接，只好自己拼接了，實(shí)驗(yàn)室里一直用DNAMAN拼接的，不過(guò)拼出來(lái)的序列導(dǎo)出后卻沒(méi)法直接拿去blast，是這樣的， GCCCAGGCGCTCATAAGGGGCATGATGAATGATGATTTGACGTCAT 300 TTTGTCACCGGCAGTCACCTTAGAGTGCCCAACTGAATGCTGGCAA 360 AAGATCAAGGGTTGCGCTCGTTGCGGGACTTAACCCAACATCTCACGA 420 還得手動(dòng)刪除后面的數(shù)字，有沒(méi)有哪位大俠知道如何讓導(dǎo)出的序列是連續(xù)的？ |
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niil
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【答案】應(yīng)助回帖
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zhsp07(gyesang代發(fā)): 金幣+1, 鼓勵(lì)回帖應(yīng)助！ 2013-04-27 14:34:04
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帶數(shù)字的序列是不影響blast的。直接拷到blast界面的序列窗口就可以了。數(shù)字會(huì)被忽略掉。 如果非要去掉數(shù)字的話，你輸出的seq文件用DNAstar里的editseq 程序打開(kāi)就可以了。我不太清楚DNAman里面是否有格式序列的功能能實(shí)現(xiàn)你的想法。 |
2樓2013-03-27 12:09:05
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3樓2013-03-27 13:52:34
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4樓2013-03-27 15:52:57
5樓2013-07-04 09:33:09
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6樓2013-07-07 09:29:42
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