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zhsp07金蟲 (小有名氣)
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[求助]
DNAMAN拼接序列如何保存為線性序列?
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華大測序的16S 未給拼接,只好自己拼接了,實(shí)驗(yàn)室里一直用DNAMAN拼接的,不過拼出來的序列導(dǎo)出后卻沒法直接拿去blast,是這樣的, GCCCAGGCGCTCATAAGGGGCATGATGAATGATGATTTGACGTCAT 300 TTTGTCACCGGCAGTCACCTTAGAGTGCCCAACTGAATGCTGGCAA 360 AAGATCAAGGGTTGCGCTCGTTGCGGGACTTAACCCAACATCTCACGA 420 還得手動刪除后面的數(shù)字,有沒有哪位大俠知道如何讓導(dǎo)出的序列是連續(xù)的? |

金蟲 (小有名氣)

金蟲 (正式寫手)
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帶數(shù)字的序列是不影響blast的。直接拷到blast界面的序列窗口就可以了。數(shù)字會被忽略掉。 如果非要去掉數(shù)字的話,你輸出的seq文件用DNAstar里的editseq 程序打開就可以了。我不太清楚DNAman里面是否有格式序列的功能能實(shí)現(xiàn)你的想法。 |

金蟲 (正式寫手)

金蟲 (小有名氣)

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