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北京石油化工學(xué)院2026年研究生招生接收調(diào)劑公告

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萱月琪琪

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[求助] gaussian中NBO計(jì)算出現(xiàn)的問(wèn)題

弱弱的問(wèn)一句 gaussian NBO計(jì)算時(shí)候，不是說(shuō)在gaussviewer中加入關(guān)鍵字pop，在linux終端輸入的最后加入$nbo plot $end 會(huì)自動(dòng)產(chǎn)生則得到FILE.31 --- FILE.41的文件的嗎? 為什么的加$nbo plot $end之后會(huì)出現(xiàn)-bash:command not found .我查看了下log文檔發(fā)現(xiàn)是正常結(jié)束的，使用chemcraf打軌跡文件的時(shí)候都是未找到該文件呢。我應(yīng)該怎么處理呢？我主要想找的是LUMO-HOMO 希望得到您的回復(fù)

我是在gv（pop=nbo）下生成gjf文件通過(guò)ssh上傳到linux服務(wù)器下。在終端中輸入的是：
[gs@localhost test]$ dos2unix GDC8.gjf
[gs@localhost test]$ g09 GDC8.gjf
$nbo plot $end
出現(xiàn)的是-bash:command not found

file.31--file.41 (資料顯示) 我沒(méi)有
File.31 AO Atomic Orbital ("the" basis set of host electronic structure system).
File.32 PNAO Pre-orthogonal* NAO
File.33 NAO Natural Atomic Orbital
File.34 PNHO Pre-orthogonal NHO
File.35 NHO Natural Hybrid Orbital
File.36 PNBO Pre-orthogonal NBO
File.37 NBO Natural Bond Orbital
File.38 PNLMO Pre-orthogonal NLMO
File.39 NLMO Natural Localized Molecular Orbital
File.40 MO Molecular Orbital (canonical; delocalized)
File.41 AO density matrix

我主要想找的是LUMO-HOMO ,我看了NBO的分析文檔，但是還是找不到。謝謝幫助

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1樓 2013-03-29 00:05:00

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$nbo plot $end不是在終端輸入的，是放在gjf文件末尾的（和前面的輸出文件空一行）
還有，要用pop=NBORead

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2樓2013-03-29 09:16:42

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2樓: Originally posted by maynard at 2013-03-29 09:16:42
$nbo plot $end不是在終端輸入的，是放在gjf文件末尾的（和前面的輸出文件空一行）
還有，要用pop=NBORead

你的意思是這個(gè)$nbo plot $end放在最最后面的，pop=NBORead也是在gv里面自己輸入的是吧？

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3樓2013-03-29 09:31:57

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3樓: Originally posted by 萱月琪琪 at 2013-03-29 09:31:57
你的意思是這個(gè)$nbo plot $end放在最最后面的，pop=NBORead也是在gv里面自己輸入的是吧？...

對(duì)的，都是在輸入文件gjf里，用什么編輯無(wú)所謂的……我一般vim的，或者直接在win下ultraedit，gv怎么輸我還不太清楚

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4樓2013-03-29 09:36:55

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你的意思是這個(gè)$nbo plot $end放在gjf最最后面的， pop=NBORead是在gv里面自己輸入的是吧？
gv里面的nbo類(lèi)型還是選的full nbo吧，checkpoint save 選項(xiàng)是don'tsave吧
NBO的基組和opt fre的基組是一樣的吧？
那還用在gv里面輸入scf=tight 嗎？
非常感謝您的幫助，我在理解上稍微有點(diǎn)問(wèn)題，希望見(jiàn)諒！

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5樓2013-03-29 09:40:59

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5樓: Originally posted by 萱月琪琪 at 2013-03-29 09:40:59
你的意思是這個(gè)$nbo plot $end放在gjf最最后面的， pop=NBORead是在gv里面自己輸入的是吧？
gv里面的nbo類(lèi)型還是選的full nbo吧，checkpoint save 選項(xiàng)是don'tsave吧
NBO的基組和opt fre的基組是一樣的吧？ ...

嘛，應(yīng)該是這樣沒(méi)錯(cuò)了，還出錯(cuò)的話再@我吧

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6樓2013-03-29 09:52:47

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6樓: Originally posted by maynard at 2013-03-29 09:52:47
嘛，應(yīng)該是這樣沒(méi)錯(cuò)了，還出錯(cuò)的話再@我吧...

我在gjf里面輸入$nbo plot $end，$nbo plot 與上面的隔了一行頂行輸入、對(duì)齊輸入剛輸入命令 [gs@localhost test]$ g09 GDC8.gjf
就掉了，打開(kāi)log出現(xiàn)的提示是：Error termination via Lnk1e in /home/gs/g09/l1.exe at Fri Mar 29 10:21:22 2013.

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7樓2013-03-29 10:24:35

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7樓: Originally posted by 萱月琪琪 at 2013-03-29 10:24:35
我在gjf里面輸入$nbo plot $end，$nbo plot 與上面的隔了一行頂行輸入、對(duì)齊輸入剛輸入命令 $ g09 GDC8.gjf
就掉了，打開(kāi)log出現(xiàn)的提示是：Error termination via Lnk1e in /home/gs/g09/l1.exe at Fri Mar 29 1 ...

不介意的話還是把輸入文件gjf傳上來(lái)給我看看吧……

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8樓2013-03-29 10:37:11

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# 行加 pop=nboread 才行。

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H                1.23442400 0.92262400 0.00009600
H                -1.23439100 0.92264600 0.00008000
H                -1.23441800 -0.92263100 0.00007000

$NBO PLOT $END

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10樓2013-03-29 10:50:19

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