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major016木蟲 (著名寫手)
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[求助]
請教HIP/HIE/HID代表什么意思
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如題。 下面這些又是什么意思？ （1）N HID NE2 & HIE ND1 （2）NH HIP ND1 & NE2 先謝謝了！ |
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wangyan10
鐵桿木蟲 (正式寫手)
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| HID HIE和HIP就是分別對應(yīng)組氨酸的三種質(zhì)子化狀態(tài)。（1）HID就是指，組氨酸的ε位置上的氮原子被質(zhì)子化；HIE值得是組氨酸的δ位置的氮原子被質(zhì)子化。（2）HIP就好理解了，就是上面提到的兩個(gè)位置的氮原子都被質(zhì)子化。希望沒記錯(cuò)，應(yīng)該是這樣的。 |
2樓2013-04-02 09:47:55
wangyan10
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3樓2013-04-02 09:50:39
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2樓說的沒錯(cuò)，是HIS的三種質(zhì)子化狀態(tài)， HID--δ位置N原子被質(zhì)子化（通俗說就是多一個(gè)H原子） HIE--ε位置N原子被質(zhì)子化 HIP-- 兩個(gè)位置都被質(zhì)子化。 具體用哪個(gè)名字，要根據(jù)HIS在你的蛋白質(zhì)中的pKa值和你的體系的pH值來確定。 一般情況下，pKa值小于pH值的情況下用HID或HIE，pKa值大于pH值的情況下用HIP。 給你一個(gè)網(wǎng)站可以評估殘基周圍的pKa值 http://propka.ki.ku.dk/ |
4樓2013-04-02 10:51:11
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