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major016木蟲 (著名寫手)
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[求助]
請教HIP/HIE/HID代表什么意思
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如題。 下面這些又是什么意思? (1)N HID NE2 & HIE ND1 (2)NH HIP ND1 & NE2 先謝謝了! |
酶的資料 |
鐵桿木蟲 (正式寫手)

鐵桿木蟲 (正式寫手)
| HID HIE和HIP就是分別對應(yīng)組氨酸的三種質(zhì)子化狀態(tài)。(1)HID就是指,組氨酸的ε位置上的氮原子被質(zhì)子化;HIE值得是組氨酸的δ位置的氮原子被質(zhì)子化。(2)HIP就好理解了,就是上面提到的兩個位置的氮原子都被質(zhì)子化。希望沒記錯,應(yīng)該是這樣的。 |

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2樓說的沒錯,是HIS的三種質(zhì)子化狀態(tài), HID--δ位置N原子被質(zhì)子化(通俗說就是多一個H原子) HIE--ε位置N原子被質(zhì)子化 HIP-- 兩個位置都被質(zhì)子化。 具體用哪個名字,要根據(jù)HIS在你的蛋白質(zhì)中的pKa值和你的體系的pH值來確定。 一般情況下,pKa值小于pH值的情況下用HID或HIE,pKa值大于pH值的情況下用HIP。 給你一個網(wǎng)站可以評估殘基周圍的pKa值 http://propka.ki.ku.dk/ |
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