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wuhen116木蟲 (正式寫手)
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[求助]
求教：重組能（reorganization energy）怎么算？
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請(qǐng)教各位一下：重組能具體的怎么算？ the reorganization energy is determined by four energies, (the Nelson four-point method):31,32 reorganization energy=（E+ *）-（E+） +（E*）-E where E+ and E are the optimized energies of the cationic and neutral forms of a single monomer, E+ * is the energy of the monomer cation at the neutral geometry, and E* is the energy of the neutral monomer at the cation geometry. 文獻(xiàn)這么說(shuō)的，但沒看懂，請(qǐng)各位指教一下，具體的怎么算？有什么需要注意的地方?jīng)]等等，我這是第一次算重組能，所以不太懂。多謝！ |
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【答案】應(yīng)助回帖
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感謝參與，應(yīng)助指數(shù) +1
wuhen116: 金幣+10, ★★★很有幫助 2013-04-03 16:12:43
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wuhen116: 金幣+10, ★★★很有幫助 2013-04-03 16:12:43
| 就是優(yōu)化一下中性分子和離子，得到E和E+。然后在優(yōu)化的中性分子的構(gòu)型下計(jì)算離子時(shí)的單點(diǎn)能（就是把中性分子優(yōu)化的gaussian輸入文件中的電荷改為1，把“opt”去掉）得到E*，在優(yōu)化的離子的構(gòu)型下計(jì)算中性分子時(shí)的單點(diǎn)能（就是把離子優(yōu)化的gaussian輸入文件中的電荷改為0，把“opt”去掉）得到E+*。再用上面的式子算出來(lái)就是了 |
2樓2013-04-03 14:37:39
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4樓2013-04-04 01:29:57
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5樓2013-04-04 10:29:49
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師兄你好，是這樣的。我最近是剛接觸gaussian軟件，對(duì)這個(gè)軟件不太熟悉。我最近要計(jì)算一下一種聚噻吩類材料的重整能（完全需要我自己搞定，沒有實(shí)驗(yàn)室老師和師兄師姐教我），看了一點(diǎn)密度泛函理論的基本概念，對(duì)于用軟件計(jì)算它的重整能目前沒有什么頭緒，我的設(shè)計(jì)材料分子目前正在跑amber分子動(dòng)力學(xué)模擬。目前我的大概思路是這樣的，amber跑完之后輸出pdb文件，我用Gview打開之后，輸出一個(gè)gif文件，我再用UltraEdit打開這個(gè)gjf文件，然后我對(duì)這個(gè)文件進(jìn)行編輯，編輯成計(jì)算重整能的格式。目前的問題是我不知道要把這個(gè)文件編輯成什么樣子，gaussian軟件的說(shuō)明書里面也沒有提到過計(jì)算重整能的關(guān)鍵詞和代碼案例，我之前也沒有編輯gaussian輸入文件的經(jīng)驗(yàn)。如果我目前的整體思路有問題，我希望師兄能夠指出來(lái)。同時(shí)我也很希望師兄能夠指導(dǎo)一下我怎么用高斯來(lái)計(jì)算重整能，也希望師兄能夠給我發(fā)一份類似材料重整能計(jì)算的代碼，非常感謝。深夜打擾非常抱歉。 |
6樓2016-04-23 02:59:01
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7樓2016-04-23 14:13:56
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