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舞昂琦VoVo木蟲(chóng) (小有名氣)
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[求助]
求助ab initio MD中SMASS設(shè)置及并行問(wèn)題
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最近在做一個(gè)ab initio MD,在選擇nvt系綜進(jìn)行模擬的過(guò)程中,出現(xiàn)幾個(gè)小問(wèn)題,求助各位: 1. 在進(jìn)行參數(shù)設(shè)置時(shí),有個(gè)跟溫控相關(guān)的參數(shù)是Nose mass,我查了手冊(cè),說(shuō)是最好設(shè)置得跟體系典型聲子頻率相當(dāng)。那我在設(shè)置的時(shí)候,是必須查文獻(xiàn)or手冊(cè)確定體系的聲子頻率(我也確定是否有相應(yīng)的資料),還是可以根據(jù)某些經(jīng)驗(yàn)規(guī)則預(yù)估一個(gè),又或者可以隨意設(shè)置一個(gè),對(duì)結(jié)果影響不大呢? 我先隨便設(shè)置了一個(gè)SMASS=1,結(jié)果顯示: SMASS = 1.00 Nose mass-parameter (am) estimated Nose-frequenzy (Omega) = 0.67E+14 period in steps = 23.35 mass= 0.878E-27a.u. 不知道這樣的結(jié)果合適么? 2. 在并行MD跑到一定步數(shù)之后,程序就會(huì)出一個(gè)Warning:Sub-Space-Matrix is not Hermitian in DAV,每步都出,相當(dāng)討厭,不知道這個(gè)警告對(duì)結(jié)果影響大么?而且這跟哪些參數(shù)有關(guān),如何設(shè)置才能避免這個(gè)Warning呢? 求助各位高手,多謝多謝!! |

木蟲(chóng) (著名寫(xiě)手)
葉落鷹飛

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葉落鷹飛

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