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舞昂琦VoVo木蟲 (小有名氣)
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[求助]
求助ab initio MD中SMASS設(shè)置及并行問題
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最近在做一個ab initio MD，在選擇nvt系綜進行模擬的過程中，出現(xiàn)幾個小問題，求助各位： 1. 在進行參數(shù)設(shè)置時，有個跟溫控相關(guān)的參數(shù)是Nose mass，我查了手冊，說是最好設(shè)置得跟體系典型聲子頻率相當。那我在設(shè)置的時候，是必須查文獻or手冊確定體系的聲子頻率（我也確定是否有相應的資料），還是可以根據(jù)某些經(jīng)驗規(guī)則預估一個，又或者可以隨意設(shè)置一個，對結(jié)果影響不大呢？ 我先隨便設(shè)置了一個SMASS=1，結(jié)果顯示： SMASS = 1.00 Nose mass-parameter (am) estimated Nose-frequenzy (Omega) = 0.67E+14 period in steps = 23.35 mass= 0.878E-27a.u. 不知道這樣的結(jié)果合適么？ 2. 在并行MD跑到一定步數(shù)之后，程序就會出一個Warning：Sub-Space-Matrix is not Hermitian in DAV，每步都出，相當討厭，不知道這個警告對結(jié)果影響大么？而且這跟哪些參數(shù)有關(guān)，如何設(shè)置才能避免這個Warning呢？ 求助各位高手，多謝多謝！！ |
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gavinliu7390
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2樓2013-04-08 21:24:12
舞昂琦VoVo
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3樓2013-04-09 19:07:40
gavinliu7390
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4樓2013-04-10 09:48:57
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