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[求助]
DS LibDOCK
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| LibDOCK是快速分子對(duì)接應(yīng)該是屬于剛性對(duì)接。為什么輸入一個(gè)配體對(duì)接后會(huì)出現(xiàn)五種不同的POSE呢？對(duì)接前已做過配體的準(zhǔn)備工作了。 |
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【答案】應(yīng)助回帖
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jiaoyixiong: 金幣+2, 鼓勵(lì)交流 2013-04-16 08:55:07
古小青: 金幣+10 2013-04-17 00:19:10
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| 剛性對(duì)接指的是蛋白質(zhì)，而不是小分子，因?yàn)樾》肿硬还軛l件如何，總是存在多種構(gòu)象的。原則上講，蛋白質(zhì)的口袋區(qū)域的某些殘基也是可以有構(gòu)象的變化，所以就有柔性對(duì)接的軟件，但是通常情況下，很多軟件對(duì)蛋白質(zhì)的柔性判斷不是特別的好，所以保守辦法還是用剛性對(duì)接比較好。 |
2樓2013-04-16 08:02:32
3樓2013-04-16 11:24:03
blue_cat
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