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糖肽(肽含量很少)用β消除法分離糖鏈和肽段后,怎么測定該反應(yīng)已經(jīng)完全反應(yīng)了?
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| 本人想鑒定糖肽中是否只有O連接,用β消除法分離糖鏈和肽段后,怎么測定該反應(yīng)已經(jīng)完全反應(yīng)了?求指教 |
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lz說的是β-消除-馬氏加成(BEMAD)方法吧。該方法O-連接糖修飾的Thr和Ser會發(fā)生β-消除反應(yīng),在α碳和側(cè)鏈原子之間形成雙鍵,二硫蘇糖醇(DTT)打開雙鍵并與硫醇形成二硫鍵,進一步通過硫醇親和柱富集糖修飾的蛋白。不知道lz是想檢測什么,如果僅僅是檢測O連糖有無,那反應(yīng)不完全應(yīng)該問題也不大。如果是想鑒定位點,那反應(yīng)完全肯定是最好的。lz可以參考復(fù)旦大學(xué)一個博士論文(作者名字忘了,你可以查一下),這個人BEMAD摸了多種方法,可能會涉及到相關(guān)反應(yīng)完全與否的檢測。 ps,如果想測定o連糖,可以嘗試pngase F酶切除N連接糖(絕大部分),再用凝集素做富集,LC-MS/MS檢測,如果lz還有時間有材料去重復(fù)這個實驗的話。 |
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