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emanlee木蟲 (小有名氣)
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[求助]
fastq format 格式代表什么意思
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我查閱了RNA-Seq fastq format 格式的文章（包括Wiki），都沒有介紹以下第一行中的這種格式的文獻(xiàn)， 請問，其中的第一行中的1代表什么意思（以下從NCBI sra下載）？ @SRR064346.723 612W1AAXX_4:1:1348:3264 length=76 GCAAGATGTACACGAGCGACAAGCTGCACTGTGAACCCGGGCACTCCGTGCCGTCGCCACCGGCCCGCG GGTCTCT +SRR064346.723 612W1AAXX_4:1:1348:3264 length=76 BBB>BBBBABB@BBAB>@?B<@@@>BB9BB;;?  B@B>>@BBB9BBB<@BB@BA@BB?BB;>B@B>@A3*1;7;B |
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【答案】應(yīng)助回帖
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silicare: 金幣+5, BioEPI+1, 應(yīng)助指數(shù)+1, 感謝參與 2013-04-20 08:35:17
| 感覺612W1AAXX_4的4應(yīng)該單獨(dú)看的，屬于flowcell lane,1是number within flowcell lane，參看http://en.wikipedia.org/wiki/FASTQ_format，或者你少給了一個位置 |
4樓2013-04-19 07:48:23
emanlee
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5樓2013-04-19 15:06:29
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6樓2013-04-20 08:27:54
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