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showerywong新蟲 (初入文壇)
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[求助]
酶蛋白突變體穩(wěn)定性的預(yù)測軟件，求助，謝謝
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各位老師，小弟在此發(fā)帖求助了！我的標(biāo)題可能描述得不清楚 問題描述：我現(xiàn)在所做的課題是酶蛋白的基因改造，其中我嘗試過易錯PCR，但是效果不好，沒有篩選到正向突變的突變基因。最近看到一篇文獻，介紹一種算法可以模擬蛋白點突變，然后進行穩(wěn)定性評估，從而計算出最適合突變的位點。根據(jù)模擬的結(jié)果，設(shè)計酶蛋白突變的位點，最后通過實驗來篩選酶學(xué)性質(zhì)更好的突變酶。 但是現(xiàn)在苦于編程水平不高，無法將上述文獻中的方法弄成軟件。想求助各位老師，有沒有類似的軟件或者網(wǎng)頁服務(wù)器。 軟件或者網(wǎng)頁服務(wù)器要求：輸入一個蛋白序列（或者PDB文件）→每個位點依次進行點突變→突變體的評估→統(tǒng)計出適合進行突變研究的位點。（類似的亦可） 謝謝各位老師，我金幣不多，有任何合適的方法都行。不一定僅限于軟件預(yù)測。易錯PCR我已經(jīng)做過，沒有太好的結(jié)果。DNA-shuffling需要很多同源性高的基因來進行（目前我只有一個基因）。點飽和突變操作起來也不簡單。 任何好方法對我都是巨大的幫助，請各位大牛不吝賜教！小弟在此感激不盡！ PS：略懂Linux操作；酶基因為1374bp |
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2樓2014-09-12 17:03:18
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