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showerywong新蟲 (初入文壇)
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[求助]
酶蛋白突變體穩(wěn)定性的預(yù)測(cè)軟件，求助，謝謝
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各位老師，小弟在此發(fā)帖求助了！我的標(biāo)題可能描述得不清楚 問題描述：我現(xiàn)在所做的課題是酶蛋白的基因改造，其中我嘗試過易錯(cuò)PCR，但是效果不好，沒有篩選到正向突變的突變基因。最近看到一篇文獻(xiàn)，介紹一種算法可以模擬蛋白點(diǎn)突變，然后進(jìn)行穩(wěn)定性評(píng)估，從而計(jì)算出最適合突變的位點(diǎn)。根據(jù)模擬的結(jié)果，設(shè)計(jì)酶蛋白突變的位點(diǎn)，最后通過實(shí)驗(yàn)來篩選酶學(xué)性質(zhì)更好的突變酶。 但是現(xiàn)在苦于編程水平不高，無法將上述文獻(xiàn)中的方法弄成軟件。想求助各位老師，有沒有類似的軟件或者網(wǎng)頁服務(wù)器。 軟件或者網(wǎng)頁服務(wù)器要求：輸入一個(gè)蛋白序列（或者PDB文件）→每個(gè)位點(diǎn)依次進(jìn)行點(diǎn)突變→突變體的評(píng)估→統(tǒng)計(jì)出適合進(jìn)行突變研究的位點(diǎn)。（類似的亦可） 謝謝各位老師，我金幣不多，有任何合適的方法都行。不一定僅限于軟件預(yù)測(cè)。易錯(cuò)PCR我已經(jīng)做過，沒有太好的結(jié)果。DNA-shuffling需要很多同源性高的基因來進(jìn)行（目前我只有一個(gè)基因）。點(diǎn)飽和突變操作起來也不簡(jiǎn)單。 任何好方法對(duì)我都是巨大的幫助，請(qǐng)各位大牛不吝賜教！小弟在此感激不盡！ PS：略懂Linux操作；酶基因?yàn)?374bp |
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2樓2014-09-12 17:03:18
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