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★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ 小木蟲(chóng): 金幣+0.5, 給個(gè)紅包,謝謝回帖 stormxuhao: 金幣+2, 積極應(yīng)助 2013-05-03 09:14:53 疾風(fēng)掠影: 金幣+10 2013-05-03 09:34:08 疾風(fēng)掠影: 金幣+10 2013-06-06 22:51:28
DGGE 和SSCP 技術(shù)都是基于相同長(zhǎng)度不同堿基序列的DNA 片段在電場(chǎng)中電泳遷移率不同而進(jìn)行分離, 但兩者形成電泳遷移率差異的原理不同。前者是雙鏈DNA 分子在含梯度變性劑的聚丙烯酰胺凝膠中變性, 從而發(fā)生空間構(gòu)型的變化;后者則是單鏈DNA 分子在非變性的聚丙烯酰胺凝膠中, 通過(guò)內(nèi)部堿基配對(duì)形成不同的空間構(gòu)象。DGGE 由于
GC 夾的特殊作用, 需要使用較長(zhǎng)的PCR 引物, 加之PCR 產(chǎn)物中的異源雙鏈DNA 分子, 在DGGE 圖譜中可能會(huì)產(chǎn)生一些“假”條帶; 而SSCP 則不受這兩種因素的影響.
前者所需要的儀器比較簡(jiǎn)單也不貴,后者需要專門的電泳儀.效果上差不多,操作時(shí),前者需要聚然降溫,引物要磷酸化;后者引物要設(shè)計(jì)GC夾子.反正都比較麻煩,DGGE是一種健全地方法,一旦優(yōu)選一個(gè)產(chǎn)物,他將很有效。結(jié)果也很容易檢測(cè)出來(lái),因?yàn)橹灰旁谧贤鉄粝乱豢淳湍芰⒖炭吹酵蛔。清晰的結(jié)果是DGGE的一個(gè)巨大的優(yōu)點(diǎn)。另外一個(gè)優(yōu)點(diǎn)是它不需要放射性標(biāo)記。SSCP需要放射性PCR或者銀染,并且結(jié)果不夠清晰。另一方面,SSCP比DGGE需要的時(shí)間少,并且不需要昂貴的材料。這就是為什么大量的樣本用這種方法的原因。例如,篩選少量的樣本要求用SSCP。DGGE適合于少選大量的長(zhǎng)周期的樣本 |
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